Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Structure and Dynamics of DNA Duplexes Containing a Cluster of Mutagenic 8-Oxoguanine and Abasic Site Lesions

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F14%3A00078633" target="_blank" >RIV/00216224:14110/14:00078633 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2013.12.022" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2013.12.022</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2013.12.022" target="_blank" >10.1016/j.jmb.2013.12.022</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Structure and Dynamics of DNA Duplexes Containing a Cluster of Mutagenic 8-Oxoguanine and Abasic Site Lesions

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Clustered DNA damage sites are caused by ionizing radiation. They are much more difficult to repair than are isolated single lesions, and their biological outcomes in terms of mutagenesis and repair inhibition are strongly dependent on the type, relativeposition and orientation of the lesions present in the cluster. To determine whether these effects on repair mechanism could be due to local structural properties within DNA, we used H-1 NMR spectroscopy and restrained molecular dynamics simulation to elucidate the structures of three DNA duplexes containing bistranded clusters of lesions. Each DNA sequence contained an abasic site in the middle of one strand and differed by the relative position of the 8-oxoguanine, staggered on either the 3' or the 5' side of the complementary strand. Their repair by base excision repair protein Fpg was either complete or inhibited. All the studied damaged DNA duplexes adopt an overall B-form conformation and the damaged residues remain intrahelical.

  • Název v anglickém jazyce

    Structure and Dynamics of DNA Duplexes Containing a Cluster of Mutagenic 8-Oxoguanine and Abasic Site Lesions

  • Popis výsledku anglicky

    Clustered DNA damage sites are caused by ionizing radiation. They are much more difficult to repair than are isolated single lesions, and their biological outcomes in terms of mutagenesis and repair inhibition are strongly dependent on the type, relativeposition and orientation of the lesions present in the cluster. To determine whether these effects on repair mechanism could be due to local structural properties within DNA, we used H-1 NMR spectroscopy and restrained molecular dynamics simulation to elucidate the structures of three DNA duplexes containing bistranded clusters of lesions. Each DNA sequence contained an abasic site in the middle of one strand and differed by the relative position of the 8-oxoguanine, staggered on either the 3' or the 5' side of the complementary strand. Their repair by base excision repair protein Fpg was either complete or inhibited. All the studied damaged DNA duplexes adopt an overall B-form conformation and the damaged residues remain intrahelical.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Molecular Biology

  • ISSN

    0022-2836

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    426

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    1524-1538

  • Kód UT WoS článku

    000334478000015

  • EID výsledku v databázi Scopus