Shared structural features of the 9aaTAD family in complex with CBP
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F15%3A00080651" target="_blank" >RIV/00216224:14110/15:00080651 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00843989:_____/15:E0104868
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1039/C4MB00672K" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1039/C4MB00672K</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1039/C4MB00672K" target="_blank" >10.1039/C4MB00672K</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Shared structural features of the 9aaTAD family in complex with CBP
Popis výsledku v původním jazyce
A number of transactivation domains for transcription factors including p53, E2A/HEB, MLL, cMyb, CREB, FOXO3, Gcn4, Oaf1 and Pdr1 have been reported to interact with the KIX domain of general transcriptional mediators CBP, p300 or MED15. Most of those factors belong to the already established Nine amino acid Transactivation Domain (9aaTAD) family. By using available structural data, we found binding analogy for the 9aaTAD in the MLL?KIX and also E2A/HEB?KIX complexes. We recognized two distinct TAD formations in the KIX complex. In the E2A/HEB?KIX complex, the leucine position is determined by the prolonged helical structure including the 9aaTAD and the leucine (long-helical TAD). However in the MLL?KIX complex, the equal position of 9aaTAD and proximal leucine is achieved differently by leucine-turn-helix structural architecture. Furthermore, the FOXO3?KIX complex shares structural analogy with the E2A?KIX complex in respect of both 9aaTAD and proximal leucine.
Název v anglickém jazyce
Shared structural features of the 9aaTAD family in complex with CBP
Popis výsledku anglicky
A number of transactivation domains for transcription factors including p53, E2A/HEB, MLL, cMyb, CREB, FOXO3, Gcn4, Oaf1 and Pdr1 have been reported to interact with the KIX domain of general transcriptional mediators CBP, p300 or MED15. Most of those factors belong to the already established Nine amino acid Transactivation Domain (9aaTAD) family. By using available structural data, we found binding analogy for the 9aaTAD in the MLL?KIX and also E2A/HEB?KIX complexes. We recognized two distinct TAD formations in the KIX complex. In the E2A/HEB?KIX complex, the leucine position is determined by the prolonged helical structure including the 9aaTAD and the leucine (long-helical TAD). However in the MLL?KIX complex, the equal position of 9aaTAD and proximal leucine is achieved differently by leucine-turn-helix structural architecture. Furthermore, the FOXO3?KIX complex shares structural analogy with the E2A?KIX complex in respect of both 9aaTAD and proximal leucine.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
ED - Fyziologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Molecular BioSystems
ISSN
1742-206X
e-ISSN
—
Svazek periodika
11
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
844-851
Kód UT WoS článku
000349995600017
EID výsledku v databázi Scopus
—