Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F20%3A00113999" target="_blank" >RIV/00216224:14110/20:00113999 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00027162:_____/19:N0000100 RIV/00027162:_____/20:N0000004

  • Výsledek na webu

    <a href="https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00203-019-01755-4" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00203-019-01755-4</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00203-019-01755-4" target="_blank" >10.1007/s00203-019-01755-4</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Pseudomonas prosekii is a recently described species isolated exclusively from James Ross Island close to the Antarctic Peninsula at 64 degrees south latitude. Here, we present two P. prosekii genome sequences and their analyses with respect to phylogeny, low temperature adaptation, and potential biotechnological applications. The genome of P. prosekii P2406 comprised 5,896,482 bp and 5324 genes (GC content of 59.71%); the genome of P. prosekii P2673 consisted of 6,087,670 bp and 5511 genes (GC content of 59.50%). Whole genome sequence comparisons confirmed a close relationship between both investigated strains and strain P. prosekii LMG 26867(T). Gene mining revealed the presence of genes involved in stress response, genes encoding cold shock proteins, oxidative stress proteins, osmoregulation proteins, genes for the synthesis of protection molecules, and siderophores. Comparative genome analysis of P. prosekii and P. aeruginosa PAO1 highlighted differences in genome content between extremophile species and a mesophilic opportunistic pathogen.

  • Název v anglickém jazyce

    Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions

  • Popis výsledku anglicky

    Pseudomonas prosekii is a recently described species isolated exclusively from James Ross Island close to the Antarctic Peninsula at 64 degrees south latitude. Here, we present two P. prosekii genome sequences and their analyses with respect to phylogeny, low temperature adaptation, and potential biotechnological applications. The genome of P. prosekii P2406 comprised 5,896,482 bp and 5324 genes (GC content of 59.71%); the genome of P. prosekii P2673 consisted of 6,087,670 bp and 5511 genes (GC content of 59.50%). Whole genome sequence comparisons confirmed a close relationship between both investigated strains and strain P. prosekii LMG 26867(T). Gene mining revealed the presence of genes involved in stress response, genes encoding cold shock proteins, oxidative stress proteins, osmoregulation proteins, genes for the synthesis of protection molecules, and siderophores. Comparative genome analysis of P. prosekii and P. aeruginosa PAO1 highlighted differences in genome content between extremophile species and a mesophilic opportunistic pathogen.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Archives of Microbiology

  • ISSN

    0302-8933

  • e-ISSN

    1432-072X

  • Svazek periodika

    202

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    447-454

  • Kód UT WoS článku

    000494779700002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85074864575