Cryptic inhibitory regions nearby activation domains

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F22%3A00129669" target="_blank" >RIV/00216224:14110/22:00129669 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S030090842200116X?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S030090842200116X?via%3Dihub</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2022.05.004" target="_blank" >10.1016/j.biochi.2022.05.004</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Cryptic inhibitory regions nearby activation domains

Popis výsledku v původním jazyce

Previously, the Nine amino acid TransActivation Domain (9aaTAD) was identified in the Gal4 region 862–870 (DDVYNYLFD). Here, we identified 9aaTADs in the distal Gal4 orthologs by our prediction algorithm and found their conservation in the family. The 9aaTAD function as strong activators was demonstrated. We identified adjacent Gal4 region 871–811 (DEDTPPNPKKE) as a natural 9aaTAD inhibitory domain located at the extreme Gal4 terminus. Moreover, we identified conserved Gal4 region 172–185 (FDWSEEDDMSDGLP), which was capable to reverse the 9aaTAD inhibition. In conclusion, our results uncover the existence of the cryptic inhibitory domains, which need to be carefully implemented in all functional studies with transcription factors to avoid incorrect conclusions.

Název v anglickém jazyce

Cryptic inhibitory regions nearby activation domains

Popis výsledku anglicky

Previously, the Nine amino acid TransActivation Domain (9aaTAD) was identified in the Gal4 region 862–870 (DDVYNYLFD). Here, we identified 9aaTADs in the distal Gal4 orthologs by our prediction algorithm and found their conservation in the family. The 9aaTAD function as strong activators was demonstrated. We identified adjacent Gal4 region 871–811 (DEDTPPNPKKE) as a natural 9aaTAD inhibitory domain located at the extreme Gal4 terminus. Moreover, we identified conserved Gal4 region 172–185 (FDWSEEDDMSDGLP), which was capable to reverse the 9aaTAD inhibition. In conclusion, our results uncover the existence of the cryptic inhibitory domains, which need to be carefully implemented in all functional studies with transcription factors to avoid incorrect conclusions.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

30105 - Physiology (including cytology)

Projekt

<a href="/cs/project/NV19-05-00410" target="_blank" >NV19-05-00410: Úloha cytotoxických gamma-delta T buněk na terapeutické rezistenci a recidivě Glioblastoma Multiforme</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Biochimie

ISSN

0300-9084

e-ISSN

1638-6183

Svazek periodika

200

Číslo periodika v rámci svazku

September 2022

Stát vydavatele periodika

FR - Francouzská republika

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

19-26

Kód UT WoS článku

000806357600003

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85130334483