Záchyt kvasinek z hemokultur a umělých materiálů od pacientů v roce 2022

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F24%3A00137596" target="_blank" >RIV/00216224:14110/24:00137596 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.med.muni.cz/tomdny" target="_blank" >https://www.med.muni.cz/tomdny</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P280-0550-2024" target="_blank" >10.5817/CZ.MUNI.P280-0550-2024</a>

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Záchyt kvasinek z hemokultur a umělých materiálů od pacientů v roce 2022

Popis výsledku v původním jazyce

Výzkum byl zaměřen na pacienty s diagnózou kandidémie nebo kvasinkovou kolonizací katetrů v roce 2022 vyšetřených na MIU FN u sv. Anny v Brně. Byly hodnoceny zachycené druhy kvasinek a jejich citlivost k antimykotikům. Dále jsme sledovali věk, pohlaví a diagnózy pacientů, délku hospitalizace a typ oddělení, na kterém byli pacienti uloženi. Hemokultury se kultivovaly v hemomatu DB Bactec FX 200 (Becton Dickinson, FR). Pozitivní záchyty se barvily podle Grama a dále kultivovaly na standardních kultivačních půdách. Katétry se vyšetřovaly semikvantitativně sonifikací (Sonorex Digital 10P, Bandelin, DE) s následnou kultivací na standardních médiích a Sabouraudově agaru (Milipore, DE). Kvasinky byly identifikovány orientačně pomocí selektivní chromogenní půdy CHROMagar (Trios, FR) a poté dourčeny MALDI TOF MS (Bruker Daltonics, USA). Citlivost k antimykotikům byla stanovena primárně difuzním diskovým testem (Liofilchem, IT) a E- testy (Biomérieux, FR), v klinicky závažných případech pomocí Sensititre YestOne (TermoFisher Scientific, USA). Z celkem 1327 pozitivních hemokultur bylo zachyceno 46 s kvasinkami od 19 pacientů. Nejčastěji byla identifikována C. albicans (CAAL, 11 pacientů), která vyrostla průměrně ve 2 lahvičkách. Dále jsme zachytili C. glabratu (CAGL, 5 pacientů), která rostla průměrně ve 4 lahvičkách, C. tropicalis (CATR, 3 pacienti) průměrně 3 záchyty a C. parapsilosis (CAPA, 1 pacient) se 3 záchyty. U 2 pacientů vyrostly kvasinky pouze v anaerobních lahvičkách a to 1 CAAL a 1 CAGL. Vyšší prevalence záchytu byla u pacientů hospitalizovaných na oddělení JIP a ARO a hospitalizovaných delší dobu než 21 dní. Věkový medián pacientů byl vyšší než 70 let a nebyl ovlivněn pohlavím. Kvasinkovou sepsí nejčastěji trpěli pacienti na chirurgii s postižením gastrointestinálního traktu (5 pacientů), což odpovídá i datům nadnárodní studie ECMM Candida III multinational European observational cohort study. Z celkem 1911 pozitivních záchytů kultivace katétrů bylo 33 od 30 pacientů s nárůstem kvasinek, 5 pacientů mělo pozitivní i hemokulturu. Nejčastěji byla identifikována CAAL (18 pacientů), dále jsme zachytili CAGL (5 pacientů), CAPA (4 pacienti), CATR (2 pacienti) a C. krusei (1 pacient). Nejčastější diagnózou pacientů s kvasinkovou kolonizací katétrů byla kardiovaskulární onemocnění.

Název v anglickém jazyce

Detection of yeast from haemocultures and artificial materials from patients in 2022

Popis výsledku anglicky

The study was focused on patients diagnosed with candidemia or yeast colonization of catheters in 2022 examined at the Microbiology department of St. Anne's Hospital in Brno. Captured yeast species and their susceptibility to antifungal agents were evaluated. We also monitored the age, sex and diagnosis of the patients, the length of hospitalization and the type of ward in which the patients were admitted. Haemocultures were cultured in a DB Bactec FX 200 haemostat (Becton Dickinson, FR). Positive catches were Gram stained and further cultured on standard culture media. Catheters were examined semi-quantitatively by sonication (Sonorex Digital 10P, Bandelin, DE) followed by culture on standard media and Sabouraud agar (Milipore, DE). Yeasts were tentatively identified using CHROMagar selective chromogenic medium (Trios, FR) and then identified with MALDI TOF MS (Bruker Daltonics, USA). Antifungal susceptibility was determined primarily by diffusion disc test (Liofilchem, IT) and E-tests (Biomérieux, FR), and in clinically severe cases by Sensitititre YestOne (TermoFisher Scientific, USA). Of the 1327 positive haemocultures, 46 with yeast from 19 patients were captured. C. albicans (CAAL, 11 patients) was the most frequently identified, growing in an average of 2 vials. We also captured C. glabrata (CAGL, 5 patients), which grew in an average of 4 vials, C. tropicalis (CATR, 3 patients) with an average of 3 captures, and C. parapsilosis (CAPA, 1 patient) with 3 captures. In 2 patients, yeasts grew only in anaerobic vials, namely 1 CAAL and 1 CAGL. The prevalence of catches was higher in patients admitted to the ICU and ARO wards and hospitalized for more than 21 days. The median age of patients was higher than 70 years and was not influenced by gender. Yeast sepsis was most common in surgical patients with gastrointestinal involvement (5 patients), which is consistent with data from the ECMM Candida III multinational European observational cohort study. Of the 1911 positive catheter culture findings, 33 were from 30 patients with yeast growth, and 5 patients also had a positive haemoculture. CAAL was the most frequently identified (18 patients), followed by CAGL (5 patients), CAPA (4 patients), CATR (2 patients) and C. krusei (1 patient). The most common diagnosis of patients with yeast colonization of catheters was cardiovascular disease.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů