Aktivace a Inhibice CDK2

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010530" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00010530 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61989592:15310/04:00002047

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Activation and Inhibition of Cyclin-Dependent Kinase-2 by Phosphorylation; A Molecular Dynamics Study Reveals the Functional Importance of the Glycine-Rich Loop

Popis výsledku v původním jazyce

Nanoseconds long molecular dynamics (MD) trajectories of differently active complexes of human cyclin-dependent kinase 2 (inactive CDK2/ATP, semi-active CDK2/Cyclin A/ATP, fully-active pT160-CDK2/Cyclin A/ATP, inhibited pT14-; pY15-; and pT14,pY15,pT160-CDK2/Cyclin A/ATP) are compared. The MD simulations results of CDK2 inhibition by phosphorylation at T14 and/or Y15 sites provide insight into structural aspects of CDK2 deactivation. The inhibitory sites are localized in the glycine-rich loop (G-loop) positioned opposite the activation T-loop. Phosphorylation of T14 and both inhibitory sites T14 and Y15 together causes ATP misalignment for phosphorylation and G-loop conformational change. This conformational change leads to the opening of the CDK2 substrate binding box. The phosphorylated Y15 residue negatively affects substrate binding or its correct alignment for ATP terminal phospho-group transfer to the CDK2 substrate. The MD simulations of the CDK2 activation process provide resul

Název v anglickém jazyce

Activation and Inhibition of Cyclin-Dependent Kinase-2 by Phosphorylation; A Molecular Dynamics Study Reveals the Functional Importance of the Glycine-Rich Loop

Popis výsledku anglicky

Nanoseconds long molecular dynamics (MD) trajectories of differently active complexes of human cyclin-dependent kinase 2 (inactive CDK2/ATP, semi-active CDK2/Cyclin A/ATP, fully-active pT160-CDK2/Cyclin A/ATP, inhibited pT14-; pY15-; and pT14,pY15,pT160-CDK2/Cyclin A/ATP) are compared. The MD simulations results of CDK2 inhibition by phosphorylation at T14 and/or Y15 sites provide insight into structural aspects of CDK2 deactivation. The inhibitory sites are localized in the glycine-rich loop (G-loop) positioned opposite the activation T-loop. Phosphorylation of T14 and both inhibitory sites T14 and Y15 together causes ATP misalignment for phosphorylation and G-loop conformational change. This conformational change leads to the opening of the CDK2 substrate binding box. The phosphorylated Y15 residue negatively affects substrate binding or its correct alignment for ATP terminal phospho-group transfer to the CDK2 substrate. The MD simulations of the CDK2 activation process provide resul

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Protein Science

ISSN

0961-8368

e-ISSN

—

Svazek periodika

13

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

1449-1457

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—