NMR experimenty pro korelaci kvarterních uhlíků v bazích RNA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010705" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00010705 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases

Popis výsledku v původním jazyce

A set of triple-resonance two-dimensional NMR experiments is presented that can be used for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and oneselective INEPT step (long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The sensitivity of all the experiments proposed is high enough to obtain a spectrum of 0.5 mM 25-mer RNA stem-loop in four hours or less on a 600 MHz (1H) spectrometer. The results show that the experiments are also applicable to samples containing agents for weak molecular alignment.

Název v anglickém jazyce

Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases

Popis výsledku anglicky

A set of triple-resonance two-dimensional NMR experiments is presented that can be used for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and oneselective INEPT step (long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The sensitivity of all the experiments proposed is high enough to obtain a spectrum of 0.5 mM 25-mer RNA stem-loop in four hours or less on a 600 MHz (1H) spectrometer. The results show that the experiments are also applicable to samples containing agents for weak molecular alignment.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LN00A016" target="_blank" >LN00A016: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

19th NMR Valtice

ISBN

80-210-3352-5

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

33

Název nakladatele

Masarykova univerzita

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Valtice

Datum konání akce

19. 4. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—