Studium nukleových kyselin v podchlazené vodě pomocí NMR metod.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00011100" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00011100 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Štúdium nukleových kyselín v podchladenej vode pomocou NMR metód.

Popis výsledku v původním jazyce

Krátke DNA oligonukloetidy, tzv. hairpins zohrávajú významnú úlohu v mnohých biologických procesoch. Najzaujímavejšou črtou takýchto biomolekúl o sekvencii d(GCGNAGC) (N = A, G, C, T) je ich výnimočná stabilita, reprezentovaná vysokou teplotou topenia, zvýšenou pohyblivosťou v polyakrylamidových géloch a odolnosťou voči nukleázam. Vyriešenie ich štruktúr nám pomáha lepšie pochopiť tieto jedinečné vlastnosti. Predčasom bola vyriešená štruktúra DNA oligonukleotidu so sekvenciou d(GCGAAGC) metódami NMR spektroskopie za použitia medziprotónových vzdialeností získaných z NOESY experimentov, torzných uhlov a zvyškových dipolárnych interakčných konštánt. Cieľom tohoto projektu je nový výpočet štruktúry uvedenej molekuly, ktorý je založený na použití medziprotónových vzdialeností z NOESY experimentov, zmeraných v podchladenej vode. V takýchto podmienkach sa intramolekulárne pohyby a chemická výmena protónov aminoskupín výrazne inhibujú. Tento prístup nám, v porovnaní so štúdiami pri izbovej te

Název v anglickém jazyce

NMR Study of Nucleic Acids In Supercooled Water

Popis výsledku anglicky

Short DNA hairpins play a significant role in a number of biological processes. The most interesting feature of the oligonucleotides with a general sequence d(GCGNAGC) (N=A,G,C,T) is their extraordinary stability represented by high melting temperatures,polyacrylamide gel mobility, and resistance against nucleases. Detailed knowledge of these structures helps understand their unique behavior. One of these fragments, the d(GCGAAGC) structure has been solved previously by NMR spectroscopy using the NOE-derived distances, torsion angles, and residual dipolar couplings. The aim of the present study is a new structure calculation of d(GCGAAGC) based on NOE data measured at temperatures below 273 K when the intramolecular motions and the chemical exchange of the amino protons are inhibited. We focused here on a comparison of number of restraints derived from the NOESY spectra at 268K and 303K, paying our attention to amino and imino connectivities within a molecule.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LN00A016" target="_blank" >LN00A016: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Sborník abstraktů, Studentská vědecká konference v oboru chemie a biochemie

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

38-38

Název nakladatele

Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně, Chemická sekce

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity

Datum konání akce

5. 5. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—