Molekulární mechanismus urzchlené konverze 1,2,3-trichloropropanu prostřednictvím mutantu haloalkandehalogenázy odhaleného strukturní a počítačovou analýzou.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00017448" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00017448 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61989592:15310/06:00004797

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Mechanism of Enhanced Conversion of 1,2,3-Trichloropropane by Mutant Haloalkane Dehalogenase Revealed by Molecular Modeling.

Popis výsledku v původním jazyce

1,2,3-Trichloropropane (TCP) is a highly toxic, recalcitrant byproduct of epichlorohydrin manufacture. Haloalkane dehalogenase (DhaA) from Rhodococcus sp. hydrolyses the carbon-halogen bond in various halogenated compounds including TCP, but with low efficiency (kcat/Km = 36 s-1M-1). A Cys176Tyr-DhaA mutant with a three-fold higher catalytic efficiency for TCP dehalogenation has been previously obtained by error-prone PCR. We have used molecular simulations and quantum mechanical calculations to elucidate the molecular mechanisms involved in the improved catalysis of the mutant, and enantioselectivity of DhaA towards TCP. The Cys176Tyr mutation modifies the protein access and export routes. Substitution of the Cys residue by the bulkier Tyr narrows theupper tunnel, making the second tunnel &quot;slot&quot; the preferred route. TCP can adopt two major orientations in the DhaA enzyme, in one of which the halide-stabilizing residue Asn41 forms a hydrogen bond with the terminal halogen at

Název v anglickém jazyce

Mechanism of Enhanced Conversion of 1,2,3-Trichloropropane by Mutant Haloalkane Dehalogenase Revealed by Molecular Modeling.

Popis výsledku anglicky

1,2,3-Trichloropropane (TCP) is a highly toxic, recalcitrant byproduct of epichlorohydrin manufacture. Haloalkane dehalogenase (DhaA) from Rhodococcus sp. hydrolyses the carbon-halogen bond in various halogenated compounds including TCP, but with low efficiency (kcat/Km = 36 s-1M-1). A Cys176Tyr-DhaA mutant with a three-fold higher catalytic efficiency for TCP dehalogenation has been previously obtained by error-prone PCR. We have used molecular simulations and quantum mechanical calculations to elucidate the molecular mechanisms involved in the improved catalysis of the mutant, and enantioselectivity of DhaA towards TCP. The Cys176Tyr mutation modifies the protein access and export routes. Substitution of the Cys residue by the bulkier Tyr narrows theupper tunnel, making the second tunnel &quot;slot&quot; the preferred route. TCP can adopt two major orientations in the DhaA enzyme, in one of which the halide-stabilizing residue Asn41 forms a hydrogen bond with the terminal halogen at

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LC512" target="_blank" >LC512: Centrum biomolekul a komplexních molekulových systémů</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

JOURNAL OF COMPUTER-AIDED MOLECULAR DESIGN

ISSN

—

e-ISSN

—

Svazek periodika

20

Číslo periodika v rámci svazku

9

Stát vydavatele periodika

CH - Švýcarská konfederace

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

375-383

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—