Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Identifikace katalytických pentád v haloalkán dehalogenáze DhmA y bakterie Mycobacterium avium N85:reakční mechanismus a molekulární evoluce.

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00017450" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00017450 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216224:14310/07:00022383

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85 showed poor expression and low stability when produced in Escherichia coli. Here we present expression DhmA in newly constructed pK4RP rhodococcal expression system in a soluble and stable form. Site-directed mutagenesis was used for the identification of a catalytic pentad, which makes up the reaction machinery of all currently known haloalkane dehalogenases. The putative catalytic triad Asp123, His279, Asp250 and the first halide-stabilizing residue Trp124 were deduced from sequence comparisons. The second stabilizing residue Trp164 was predicted from a homology model. Five point mutants in the catalytic pentad were constructed, tested for activity and were found inactive. A two-step reactionmechanism was proposed for DhmA. Evolution of different types of catalytic pentads and molecular adaptation towards the synthetic substrate 1,2-dichloroethane within the protein family is discussed.

  • Název v anglickém jazyce

    The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution

  • Popis výsledku anglicky

    Haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85 showed poor expression and low stability when produced in Escherichia coli. Here we present expression DhmA in newly constructed pK4RP rhodococcal expression system in a soluble and stable form. Site-directed mutagenesis was used for the identification of a catalytic pentad, which makes up the reaction machinery of all currently known haloalkane dehalogenases. The putative catalytic triad Asp123, His279, Asp250 and the first halide-stabilizing residue Trp124 were deduced from sequence comparisons. The second stabilizing residue Trp164 was predicted from a homology model. Five point mutants in the catalytic pentad were constructed, tested for activity and were found inactive. A two-step reactionmechanism was proposed for DhmA. Evolution of different types of catalytic pentads and molecular adaptation towards the synthetic substrate 1,2-dichloroethane within the protein family is discussed.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2006

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    1/2006

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    9999

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus