Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Elastické vlastnosti stavebných blokov ribozomálnej RNA: molekulová dynamika GTPase-associated center rRNA

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F07%3A00022189" target="_blank" >RIV/00216224:14310/07:00022189 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68081707:_____/07:00087248

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Elastic properties of ribosomal RNA building blocks: molecular dynamics of the GTPase-associated center rRNA

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Explicit solvent Molecular Dynamics (MD) was used to describe the intrinsic flexibility of the Helix 42-44 portion of the 23S rRNA (abbreviated as Kt-42+rGAC; Kink-turn 42 and GTPase associated center rRNA). The bottom part of this molecule consists of alternating rigid and flexible segments. The first flexible segment (Hinge1) is the highly anharmonic Kink of Kt-42. The second one (Hinge2) is localized at the junction between Helix 42 and Helices 43/44. The rigid segments are the two arms of Helix 42 flanking the Kink. The whole molecule ends up with compact Helices 43/44 (Head) which appear to be modestly compressed towards the subunit in the H.m. x-ray structure. Overall, the Helix 42-44 rRNA is constructed as a sophisticated intrinsically flexibleanisotropic molecular limb. The leading flexibility modes include bending at the hinges and twisting. The Head shows visible internal conformational plasticity, stemming from an intricate set of base pairing patterns including dynamical t

  • Název v anglickém jazyce

    Elastic properties of ribosomal RNA building blocks: molecular dynamics of the GTPase-associated center rRNA

  • Popis výsledku anglicky

    Explicit solvent Molecular Dynamics (MD) was used to describe the intrinsic flexibility of the Helix 42-44 portion of the 23S rRNA (abbreviated as Kt-42+rGAC; Kink-turn 42 and GTPase associated center rRNA). The bottom part of this molecule consists of alternating rigid and flexible segments. The first flexible segment (Hinge1) is the highly anharmonic Kink of Kt-42. The second one (Hinge2) is localized at the junction between Helix 42 and Helices 43/44. The rigid segments are the two arms of Helix 42 flanking the Kink. The whole molecule ends up with compact Helices 43/44 (Head) which appear to be modestly compressed towards the subunit in the H.m. x-ray structure. Overall, the Helix 42-44 rRNA is constructed as a sophisticated intrinsically flexibleanisotropic molecular limb. The leading flexibility modes include bending at the hinges and twisting. The Head shows visible internal conformational plasticity, stemming from an intricate set of base pairing patterns including dynamical t

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2007

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nucleic Acids Research

  • ISSN

    0305-1048

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    35

  • Číslo periodika v rámci svazku

    12

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    4007-4017

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus