Využití metody ARDRA pro druhovou identifikaci nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F07%3A00022495" target="_blank" >RIV/00216224:14310/07:00022495 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití metody ARDRA pro druhovou identifikaci nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium

Popis výsledku v původním jazyce

Pomocí ARDRA analýzy identifikovat bakteriální kmeny isolované z humánních zdrojů, které byly rodově specifickou PCR zařazeny do rodu Bifidobacterium a které při použití druhově specifických PCR vykazovaly zkřížené reakce a proto nemohly být zařazeny dodruhů. Restrikční analýza amplikonu 914bp pomocí restriktáz AluI a Sau3 AI umožnila odlišení druhů B .adolescentis, B. bifidum, B. breve, B. catenulatum, B. infantis a B. longum. Celkem bylo rozlišeno a zařazeno do druhů deset z jedenácti nově isolovaných kmenů. Lze konstatovat, že ARDRA analýza je rychlá a reprodukovatelná identifikační metoda s vysokým diskriminačním potenciálem na úrovni druhu.

Název v anglickém jazyce

The use of ARDRA method for specific identification of new Bifidobacterium strains

Popis výsledku anglicky

ARDRA analysis was used for the identification of 11 selected bacterial strains isolated from human sources. These strains were identified into the genus Bifidobacterium using genus-specific PCR. However they could not be identified into species using species-specific PCR due to the cross reactions. Analysis of genus specific amplicon of 914 bp using restrictases AluI and Sau3AI enabled the differentiation of species B. adolescentis, B. bifidum, B. breve, B. catenulatum, B. infantis and B. longum. Alltogether 10 strains could be identified into species. In conclusion, ARDRA analysis is a quick and reproducible identification procedure with high discrimination potential for individual species.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QF3169" target="_blank" >QF3169: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů

ISBN

978-80-210-4234-6

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

64-65

Název nakladatele

Masarykova univerzita

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

31. 1. 2007

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—