Velikost genomu u šáchorovitých

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F08%3A00024944" target="_blank" >RIV/00216224:14310/08:00024944 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Genome size in Cyperaceae

Popis výsledku v původním jazyce

In organisms with monocentric chromosomes, the chromosome numbers are sufficient for the estimation of ploidy level. In Cyperaceae the detection of polyploidy is complicated by chromosomal fusion and fragmentation (symploidy and agmatoploidy) due to holokinetic nature of chromosomes. Studying karyotype and genome size in Cyperaceae, we combined (i) molecular methods, (ii) flow cytometry, and (iii) traditional chromosome counts in Carex and Eleocharis. These genera are contrasting in (i) number of species, (ii) evolutionary centres, (iii) ecological diversification, but mainly in (iv) genome size and chromosome size variation, which is in Eleocharis one of the largest known among angiosperm genera (36.5 fold: from 8.1 Mbp per chromosome in E. quinqueflora to 296 Mbp per chromosome in E. austriaca). We analysed the following genomic parameters: (i) genome size, (ii) chromosome number, (iii) chromosome size, (iv) AT/GC composition, (v-vi) Ty3-gypsy and Ty1-copia retrotransposons diversity

Název v anglickém jazyce

Genome size in Cyperaceae

Popis výsledku anglicky

In organisms with monocentric chromosomes, the chromosome numbers are sufficient for the estimation of ploidy level. In Cyperaceae the detection of polyploidy is complicated by chromosomal fusion and fragmentation (symploidy and agmatoploidy) due to holokinetic nature of chromosomes. Studying karyotype and genome size in Cyperaceae, we combined (i) molecular methods, (ii) flow cytometry, and (iii) traditional chromosome counts in Carex and Eleocharis. These genera are contrasting in (i) number of species, (ii) evolutionary centres, (iii) ecological diversification, but mainly in (iv) genome size and chromosome size variation, which is in Eleocharis one of the largest known among angiosperm genera (36.5 fold: from 8.1 Mbp per chromosome in E. quinqueflora to 296 Mbp per chromosome in E. austriaca). We analysed the following genomic parameters: (i) genome size, (ii) chromosome number, (iii) chromosome size, (iv) AT/GC composition, (v-vi) Ty3-gypsy and Ty1-copia retrotransposons diversity

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EF - Botanika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

The Comparative Biology of the Monocotyledons

ISBN

978-87-87772-03-7

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

—

Název nakladatele

University of Copenhagen

Místo vydání

Copenhagen

Místo konání akce

Copenhagen

Datum konání akce

1. 1. 2008

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—