Studium protein-proteinových interakcí in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F09%3A00039686" target="_blank" >RIV/00216224:14310/09:00039686 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Studium protein-proteinových interakcí in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
Popis výsledku v původním jazyce
Schopnost interagovat s dalšími proteiny je jednou ze základních charakteristik proteinů. K rychlému vyhledání interakčních partnerů rostlinných proteinů používáme několik metod pro in vivo analýzu proteinových interakcí v kvasinkách, nebo v transientnětransoformovaných listech tabáku Nicotiana benthamiana. Kvasinkový dvouhybridní systém (Yeast two-hybrid system, Y2H) je klasickou metodou pro analýzu proteinových interakcí a je vhodné jej použít pro získání prvních interakčních informací. Výsledky je proto nutné ověřit jinými nezávislými metodami. Jednou z takových metod je bimolekulární fluorescenční komplementace (Bimolecular Fluorescence Complementation, BiFC). Další metodou vhodnou pro analýzu interakcí mezi membránovým proteinem a cytosolikcými proteiny zprostředkované vazby na membránu (Membrane Recruitment Assay, MeRA). Pro konstrukci rekombinantní DNA používáme ve všech třech popsaných případech klonování prostřednictvím Gateway technologie.
Název v anglickém jazyce
Studying protein-protein interactions in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
Popis výsledku anglicky
One of the fundamental characteristic of protein is the ability to interact with other proteins. Several methods are used to find interaction partners of proteins and study protein-protein interactions in vivo, e.g. in yeast or transiently transformed Nicotiana benthamiana leaves. Yeast two-hybrid assay is classical method used to obtain first information about protein interaction partners. However, it is necessary to verify yeast results by independent methods like bimolecular fluorescence complementation (BiFC) in tobacco leaves. Another method with similar experimental setup is membrane recruitment assay, which is used for studyin interactions between membrane and cytosolic protein. To construct recombinant DNA for all in vivo interaction methods, Gateway technology is used for cloning.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LC06034" target="_blank" >LC06034: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů