Single-base Resolution Nucleosome Mapping on DNA Sequences
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F10%3A00045999" target="_blank" >RIV/00216224:14310/10:00045999 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Single-base Resolution Nucleosome Mapping on DNA Sequences
Popis výsledku v původním jazyce
Nucleosome DNA bendahility pattern extracted from large nucleosome DNA database of C. elegans is used for construction of full length (116 dinucleotide positions) nucleosome DNA bendahility matrix. The matrix can he used for sequence-directed mapping ofthe nucleosomes on the sequences. Several alternative positions for a given nucleosome are typically predicted. separated by multiples of nucleosome DNA period. The corresponding computer program is successfully tested on best known experimental examplesof accurately positioned nucleosomes. The uncertainty of the computational mapping is +/- 1 base. The procedure is placed on publicly accessible server and can he applied to any DNA sequence of interest.
Název v anglickém jazyce
Single-base Resolution Nucleosome Mapping on DNA Sequences
Popis výsledku anglicky
Nucleosome DNA bendahility pattern extracted from large nucleosome DNA database of C. elegans is used for construction of full length (116 dinucleotide positions) nucleosome DNA bendahility matrix. The matrix can he used for sequence-directed mapping ofthe nucleosomes on the sequences. Several alternative positions for a given nucleosome are typically predicted. separated by multiples of nucleosome DNA period. The corresponding computer program is successfully tested on best known experimental examplesof accurately positioned nucleosomes. The uncertainty of the computational mapping is +/- 1 base. The procedure is placed on publicly accessible server and can he applied to any DNA sequence of interest.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS
ISSN
0739-1102
e-ISSN
—
Svazek periodika
28
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000278516000009
EID výsledku v databázi Scopus
—