Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Reaction Mechanism of MutH Enzyme - Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study 2

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F11%3A00050263" target="_blank" >RIV/00216224:14310/11:00050263 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Reaction Mechanism of MutH Enzyme - Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study 2

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Knowledge of enzymes reaction mechanisms can be helpful in many fields such as biology, medicine or pharmacy. In our study, we are focused on MutH enzyme, which is an integral part of Methyl-directed Mismatch Repair together with MutL and MutS enzymes. Amismatch introduced during DNA replication is recognized by MutS enzyme, information about the mismatch is transferred through MutL to MutH enzyme. MutH specifically recognizes the GATC sequence on daughter DNA strand and cleaves this strand close to the G base. Wrong paired base is removed and after that the correct base pairing is reestablished [1]. Main goal of our project is the understanding of the reaction mechanism of MutH enzyme. We present the Quantum Mechanics / Molecular Mechanics (QM/MM) study of the MutH enzyme reactivity based on models prepared from the available crystal structures of protein / DNA complex [2]. The cleavage mechanism is studied on ab-initio level using CPMD implementation of Density Functional Theory.

  • Název v anglickém jazyce

    Reaction Mechanism of MutH Enzyme - Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study 2

  • Popis výsledku anglicky

    Knowledge of enzymes reaction mechanisms can be helpful in many fields such as biology, medicine or pharmacy. In our study, we are focused on MutH enzyme, which is an integral part of Methyl-directed Mismatch Repair together with MutL and MutS enzymes. Amismatch introduced during DNA replication is recognized by MutS enzyme, information about the mismatch is transferred through MutL to MutH enzyme. MutH specifically recognizes the GATC sequence on daughter DNA strand and cleaves this strand close to the G base. Wrong paired base is removed and after that the correct base pairing is reestablished [1]. Main goal of our project is the understanding of the reaction mechanism of MutH enzyme. We present the Quantum Mechanics / Molecular Mechanics (QM/MM) study of the MutH enzyme reactivity based on models prepared from the available crystal structures of protein / DNA complex [2]. The cleavage mechanism is studied on ab-initio level using CPMD implementation of Density Functional Theory.

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2011

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů