Enterococcus alcedinis sp. nov., isolated from common kingfisher (Alcedo atthis)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F13%3A00068968" target="_blank" >RIV/00216224:14310/13:00068968 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/62157124:16270/13:43872421 RIV/62157124:16810/13:43872421
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.049833-0" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.049833-0</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.049833-0" target="_blank" >10.1099/ijs.0.049833-0</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Enterococcus alcedinis sp. nov., isolated from common kingfisher (Alcedo atthis)
Popis výsledku v původním jazyce
Two Gram-positive, catalase-negative bacterial strains were isolated from the cloaca of common kingfishers (Alcedo atthis). Repetitive sequence-based PCR fingerprinting using the (GTG)5 primer grouped these isolates into a single cluster separated from all known enterococcal species. The two strains revealed identical 16S rRNA gene sequences placing them within the genus Enterococcus with Enterococcus aquimarinus LMG 16607T as the closest relative (97.14% similarity). Further taxonomic investigation using sequencing of the genes for the superoxide dismutase (sodA), phenylalanyl-tRNA synthase alpha subunit (pheS) and the RNA polymerase alpha subunit (rpoA) as well as application of whole-cell protein fingerprinting, automated ribotyping and extensive phenotyping confirmed that both strains belong to the same species. Based on data from this polyphasic study, these strains represent a novel species of the genus Enterococcus, for which the name Enterococcus alcedinis sp. nov. is proposed.
Název v anglickém jazyce
Enterococcus alcedinis sp. nov., isolated from common kingfisher (Alcedo atthis)
Popis výsledku anglicky
Two Gram-positive, catalase-negative bacterial strains were isolated from the cloaca of common kingfishers (Alcedo atthis). Repetitive sequence-based PCR fingerprinting using the (GTG)5 primer grouped these isolates into a single cluster separated from all known enterococcal species. The two strains revealed identical 16S rRNA gene sequences placing them within the genus Enterococcus with Enterococcus aquimarinus LMG 16607T as the closest relative (97.14% similarity). Further taxonomic investigation using sequencing of the genes for the superoxide dismutase (sodA), phenylalanyl-tRNA synthase alpha subunit (pheS) and the RNA polymerase alpha subunit (rpoA) as well as application of whole-cell protein fingerprinting, automated ribotyping and extensive phenotyping confirmed that both strains belong to the same species. Based on data from this polyphasic study, these strains represent a novel species of the genus Enterococcus, for which the name Enterococcus alcedinis sp. nov. is proposed.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
ISSN
1466-5026
e-ISSN
—
Svazek periodika
63
Číslo periodika v rámci svazku
8
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
3069-3074
Kód UT WoS článku
000330271400049
EID výsledku v databázi Scopus
—