Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F14%3A00074400" target="_blank" >RIV/00216224:14310/14:00074400 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.pnas.org/content/111/39/E4096.abstract" target="_blank" >http://www.pnas.org/content/111/39/E4096.abstract</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1321152111" target="_blank" >10.1073/pnas.1321152111</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots

Popis výsledku v původním jazyce

Genomic DNA base composition (GC content) is predicted to significantly affect genome functioning and species ecology. Although several hypotheses have been put forward to address the biological impact of GC content variation in microbial and vertebrateorganisms, the biological significance of GC content diversity in plants remains unclear because of a lack of sufficiently robust genomic data. Using flow cytometry, we report genomic GC contents for 239 species representing 70 of 78 monocot families andcompare them with genomic characters, a suite of life history traits and climatic niche data using phylogeny-based statistics. GC content of monocots varied between 33.6% and 48.9%, with several groups exceeding the GC content known for any other vascular plant group, highlighting their unusual genome architecture and organization.

Název v anglickém jazyce

Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots

Popis výsledku anglicky

Genomic DNA base composition (GC content) is predicted to significantly affect genome functioning and species ecology. Although several hypotheses have been put forward to address the biological impact of GC content variation in microbial and vertebrateorganisms, the biological significance of GC content diversity in plants remains unclear because of a lack of sufficiently robust genomic data. Using flow cytometry, we report genomic GC contents for 239 species representing 70 of 78 monocot families andcompare them with genomic characters, a suite of life history traits and climatic niche data using phylogeny-based statistics. GC content of monocots varied between 33.6% and 48.9%, with several groups exceeding the GC content known for any other vascular plant group, highlighting their unusual genome architecture and organization.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EF - Botanika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

ISSN

0027-8424

e-ISSN

—

Svazek periodika

111

Číslo periodika v rámci svazku

39

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

"E4096"-"E4102"

Kód UT WoS článku

000342350200008

EID výsledku v databázi Scopus

—