A Complex Distribution of Elongation Family GTPases EF1A and EFL in Basal Alveolate Lineages
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F14%3A00074440" target="_blank" >RIV/00216224:14310/14:00074440 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evu186" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evu186</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evu186" target="_blank" >10.1093/gbe/evu186</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A Complex Distribution of Elongation Family GTPases EF1A and EFL in Basal Alveolate Lineages
Popis výsledku v původním jazyce
Translation elongation factor-1 alpha (EF1A) and the related GTPase EF-like (EFL) are two proteins with a complex mutually exclusive distribution across the tree of eukaryotes. Recent surveys revealed that the distribution of the two GTPases in even closely related taxa is frequently at odds with their phylogenetic relationships. Here, we investigate the distribution of EF1A and EFL in the alveolate supergroup. Alveolates comprise three major lineages: ciliates andapicomplexans encode EF1A, whereas dinoflagellates encode EFL. We searched transcriptome databases for seven early-diverging alveolate taxa that do not belong to any of these groups: colpodellids, chromerids, and colponemids. Current data suggest all seven are expected to encode EF1A, but wefind three genera encode EFL: Colpodella,Voromonas, and the photosyntheticChromera.
Název v anglickém jazyce
A Complex Distribution of Elongation Family GTPases EF1A and EFL in Basal Alveolate Lineages
Popis výsledku anglicky
Translation elongation factor-1 alpha (EF1A) and the related GTPase EF-like (EFL) are two proteins with a complex mutually exclusive distribution across the tree of eukaryotes. Recent surveys revealed that the distribution of the two GTPases in even closely related taxa is frequently at odds with their phylogenetic relationships. Here, we investigate the distribution of EF1A and EFL in the alveolate supergroup. Alveolates comprise three major lineages: ciliates andapicomplexans encode EF1A, whereas dinoflagellates encode EFL. We searched transcriptome databases for seven early-diverging alveolate taxa that do not belong to any of these groups: colpodellids, chromerids, and colponemids. Current data suggest all seven are expected to encode EF1A, but wefind three genera encode EFL: Colpodella,Voromonas, and the photosyntheticChromera.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EG - Zoologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP505%2F12%2FG112" target="_blank" >GBP505/12/G112: ECIP - Evropské centrum ichtyoparazitologie</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Genome Biology Evolution
ISSN
1759-6653
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
9
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
2361-2367
Kód UT WoS článku
000343249300015
EID výsledku v databázi Scopus
—