AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F15%3A00081192" target="_blank" >RIV/00216224:14310/15:00081192 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0099-x" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0099-x</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0099-x" target="_blank" >10.1186/s13321-015-0099-x</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules

Popis výsledku v původním jazyce

This paper introduces AtomicChargeCalculator (ACC), a web-based application for the calculation and analysis of atomic charges which respond to changes in molecular conformation and chemical environment. ACC relies on an empirical method to rapidly compute atomic charges with accuracy comparable to quantum mechanical approaches. Due to its efficient implementation, ACC can handle any type of molecular system, regardless of size and chemical complexity, from drug-like molecules to biomacromolecular complexes with hundreds of thousands of atoms. ACC writes out atomic charges into common molecular structure files, and offers interactive facilities for statistical analysis and comparison of the results, in both tabular and graphical form.

Název v anglickém jazyce

AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules

Popis výsledku anglicky

This paper introduces AtomicChargeCalculator (ACC), a web-based application for the calculation and analysis of atomic charges which respond to changes in molecular conformation and chemical environment. ACC relies on an empirical method to rapidly compute atomic charges with accuracy comparable to quantum mechanical approaches. Due to its efficient implementation, ACC can handle any type of molecular system, regardless of size and chemical complexity, from drug-like molecules to biomacromolecular complexes with hundreds of thousands of atoms. ACC writes out atomic charges into common molecular structure files, and offers interactive facilities for statistical analysis and comparison of the results, in both tabular and graphical form.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Cheminformatics

ISSN

1758-2946

e-ISSN

—

Svazek periodika

7

Číslo periodika v rámci svazku

50

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

13

Strana od-do

"nestránkováno"

Kód UT WoS článku

000363291500001

EID výsledku v databázi Scopus

—