Classification of strain CCM 4446T as Rhodococcus degradans sp. nov.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F15%3A00086923" target="_blank" >RIV/00216224:14310/15:00086923 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61989100:27350/15:86093990
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.000584" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.000584</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.000584" target="_blank" >10.1099/ijsem.0.000584</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Classification of strain CCM 4446T as Rhodococcus degradans sp. nov.
Popis výsledku v původním jazyce
Strain CCM 4446T, with notable biodegradation capabilities, was investigated in this study in order to elucidate its taxonomic position. Chemotaxonomic analyses of quinones, polar lipids, mycolic acids, polyamines and the diamino acid of the cell-wall peptidoglycan corresponded with characteristics of the genus Rhodococcus. Phylogenetic analysis, based on the 16S rRNA gene sequence, assigned strain CCM 4446T to the genus Rhodococcus and placed it in the Rhodococcus erythropolis 16S rRNA gene clade. Further analysis of catA and gyrB gene sequences, automated ribotyping with EcoRI restriction endonuclease, whole-cell protein profiling, DNA?DNA hybridization and extensive biotyping enabled differentiation of strain CCM 4446T from all phylogenetically closely related species, i.e., Rhodococcus baikonurensis, Rhodococcus qingshengii, Rhodococcus erythropolis and Rhodococcus globerulus.
Název v anglickém jazyce
Classification of strain CCM 4446T as Rhodococcus degradans sp. nov.
Popis výsledku anglicky
Strain CCM 4446T, with notable biodegradation capabilities, was investigated in this study in order to elucidate its taxonomic position. Chemotaxonomic analyses of quinones, polar lipids, mycolic acids, polyamines and the diamino acid of the cell-wall peptidoglycan corresponded with characteristics of the genus Rhodococcus. Phylogenetic analysis, based on the 16S rRNA gene sequence, assigned strain CCM 4446T to the genus Rhodococcus and placed it in the Rhodococcus erythropolis 16S rRNA gene clade. Further analysis of catA and gyrB gene sequences, automated ribotyping with EcoRI restriction endonuclease, whole-cell protein profiling, DNA?DNA hybridization and extensive biotyping enabled differentiation of strain CCM 4446T from all phylogenetically closely related species, i.e., Rhodococcus baikonurensis, Rhodococcus qingshengii, Rhodococcus erythropolis and Rhodococcus globerulus.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EE2.3.20.0183" target="_blank" >EE2.3.20.0183: Centrum experimentální biomedicíny</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
ISSN
1466-5026
e-ISSN
—
Svazek periodika
65
Číslo periodika v rámci svazku
December
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
4381-4387
Kód UT WoS článku
000370460600014
EID výsledku v databázi Scopus
—