Whole genome amplification effect on segmental copy-number changes and copy-number neutral loss of heterozygosity analysis by oligonucleotide-array based comparative genomic hybridization in human myeloma cell line
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F16%3A00088952" target="_blank" >RIV/00216224:14310/16:00088952 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Whole genome amplification effect on segmental copy-number changes and copy-number neutral loss of heterozygosity analysis by oligonucleotide-array based comparative genomic hybridization in human myeloma cell line
Popis výsledku v původním jazyce
Whole genome amplification (WGA) is an approach designed to overcome small amounts of DNA for genome-wide genetic tests used in many clinical applications. Various strategies of WGA have been developed; however, none of them can guarantee the absence of amplification bias. In this study, a total of 4 multiple displacement amplification (MDA)-based and 2 PCR-based WGA kits were compared in their effect on segmental copy-number (CN) changes and copy-number neutral loss of heterozygosity (cnnLOH) detection by 3 microarray platforms: CGH/4×44 K (Agilent), CGH+SNP/4×180 K (Agilent) and CGH+SNP/4×180 K (OGT). Genomic imbalances-rich myeloma cell line U266 was used as material.
Název v anglickém jazyce
Whole genome amplification effect on segmental copy-number changes and copy-number neutral loss of heterozygosity analysis by oligonucleotide-array based comparative genomic hybridization in human myeloma cell line
Popis výsledku anglicky
Whole genome amplification (WGA) is an approach designed to overcome small amounts of DNA for genome-wide genetic tests used in many clinical applications. Various strategies of WGA have been developed; however, none of them can guarantee the absence of amplification bias. In this study, a total of 4 multiple displacement amplification (MDA)-based and 2 PCR-based WGA kits were compared in their effect on segmental copy-number (CN) changes and copy-number neutral loss of heterozygosity (cnnLOH) detection by 3 microarray platforms: CGH/4×44 K (Agilent), CGH+SNP/4×180 K (Agilent) and CGH+SNP/4×180 K (OGT). Genomic imbalances-rich myeloma cell line U266 was used as material.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/NT13492" target="_blank" >NT13492: Úloha genetických abnormalit ve vývoji a progresi prekancerózy monoklonální gamapatie nejasného významu</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Clinical and Experimental Pathology
ISSN
1936-2625
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
16
Strana od-do
6965
Kód UT WoS článku
000381729200036
EID výsledku v databázi Scopus
—