Differential Isotope Labeling of Glycopeptides for Accurate Determination of Differences in Site-Specific Glycosylation

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F16%3A00093930" target="_blank" >RIV/00216224:14310/16:00093930 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.5b00899" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.5b00899</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.5b00899" target="_blank" >10.1021/acs.jproteome.5b00899</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Differential Isotope Labeling of Glycopeptides for Accurate Determination of Differences in Site-Specific Glycosylation

Popis výsledku v původním jazyce

We introduce a stable isotope labeling approach for glycopeptides that allows a specific glycosylation site in a protein to be quantitatively evaluated using mass spectrometry. Succinic anhydride is used to specifically label primary amino groups of the peptide portion of the glycopeptides. The heavy form ((D4C4)-C-13) provides an 8 Da mass increment over the light natural form ((H4C4)-C-12), allowing simultaneous analysis and direct comparison of two glycopeptide profiles in a single MS scan. We have optimized a protocol for an in-solution trypsin digestion, a one-pot labeling procedure, and a post-labeling solid-phase extraction to obtain purified and labeled glycopeptides. We provide the first demonstration of this approach by comparing IgGI Pc glycopeptides from polyclonal IgG samples with respect to their galactosylation and sialylation patterns using MALDI MS and LC-ESI-MS.

Název v anglickém jazyce

Differential Isotope Labeling of Glycopeptides for Accurate Determination of Differences in Site-Specific Glycosylation

Popis výsledku anglicky

We introduce a stable isotope labeling approach for glycopeptides that allows a specific glycosylation site in a protein to be quantitatively evaluated using mass spectrometry. Succinic anhydride is used to specifically label primary amino groups of the peptide portion of the glycopeptides. The heavy form ((D4C4)-C-13) provides an 8 Da mass increment over the light natural form ((H4C4)-C-12), allowing simultaneous analysis and direct comparison of two glycopeptide profiles in a single MS scan. We have optimized a protocol for an in-solution trypsin digestion, a one-pot labeling procedure, and a post-labeling solid-phase extraction to obtain purified and labeled glycopeptides. We provide the first demonstration of this approach by comparing IgGI Pc glycopeptides from polyclonal IgG samples with respect to their galactosylation and sialylation patterns using MALDI MS and LC-ESI-MS.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CB - Analytická chemie, separace

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Proteome Research

ISSN

1535-3893

e-ISSN

—

Svazek periodika

15

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

326-331

Kód UT WoS článku

000367706000026

EID výsledku v databázi Scopus

—