The use of high resolution melting analysis of ITS-1 for rapid differentiation of parasitic nematodes Haemonchus contortus and Ashworthius sidemi

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F20%3A00116517" target="_blank" >RIV/00216224:14310/20:00116517 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.nature.com/articles/s41598-020-73037-9" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41598-020-73037-9</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-73037-9" target="_blank" >10.1038/s41598-020-73037-9</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The use of high resolution melting analysis of ITS-1 for rapid differentiation of parasitic nematodes Haemonchus contortus and Ashworthius sidemi

Popis výsledku v původním jazyce

Among gastrointestinal nematodes, haematophagous strongylids Haemonchus contortus and Ashworthius sidemi belong to the most pathogenic parasites of both domestic and wild ruminants. Correct identification of parasitic taxa is of crucial importance in many areas of parasite research, including monitoring of occurrence, epidemiological studies, or testing of effectiveness of therapy. In this study, we identified H. contortus and A. sidemi in a broad range of ruminant hosts that occur in the Czech Republic using morphological/morphometric and molecular approaches. As an advanced molecular method, we employed qPCR followed by High Resolution Melting analysis, specifically targeting the internal transcribed spacer 1 (ITS-1) sequence to distinguish the two nematode species. We demonstrate that High Resolution Melting curves allow for taxonomic affiliation, making it a convenient, rapid, and reliable identification tool.

Název v anglickém jazyce

The use of high resolution melting analysis of ITS-1 for rapid differentiation of parasitic nematodes Haemonchus contortus and Ashworthius sidemi

Popis výsledku anglicky

Among gastrointestinal nematodes, haematophagous strongylids Haemonchus contortus and Ashworthius sidemi belong to the most pathogenic parasites of both domestic and wild ruminants. Correct identification of parasitic taxa is of crucial importance in many areas of parasite research, including monitoring of occurrence, epidemiological studies, or testing of effectiveness of therapy. In this study, we identified H. contortus and A. sidemi in a broad range of ruminant hosts that occur in the Czech Republic using morphological/morphometric and molecular approaches. As an advanced molecular method, we employed qPCR followed by High Resolution Melting analysis, specifically targeting the internal transcribed spacer 1 (ITS-1) sequence to distinguish the two nematode species. We demonstrate that High Resolution Melting curves allow for taxonomic affiliation, making it a convenient, rapid, and reliable identification tool.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/LTC19018" target="_blank" >LTC19018: Pilotní strategický plán boje s rezistentními kmeny parazitických červů v českých hospodářských chovech přežvýkavců</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Scientific reports

ISSN

2045-2322

e-ISSN

—

Svazek periodika

10

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

1-9

Kód UT WoS článku

000577130100003

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85091716166