Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Galaxy InteractoMIX: An Integrated Computational Platform for the Study of Protein–Protein Interaction Data

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F21%3A00121019" target="_blank" >RIV/00216224:14310/21:00121019 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1016/j.jmb.2020.09.015" target="_blank" >https://doi.org/10.1016/j.jmb.2020.09.015</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2020.09.015" target="_blank" >10.1016/j.jmb.2020.09.015</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Galaxy InteractoMIX: An Integrated Computational Platform for the Study of Protein–Protein Interaction Data

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Protein interactions play a crucial role among the different functions of a cell and are central to our understanding of cellular processes both in health and disease. Here we present Galaxy InteractoMIX (http://galaxy.interactomix.com), a platform composed of 13 different computational tools each addressing specific aspects of the study of protein–protein interactions, ranging from large-scale cross-species protein-wide interactomes to atomic resolution level of protein complexes. Galaxy InteractoMIX provides an intuitive interface where users can retrieve consolidated interactomics data distributed across several databases or uncover links between diseases and genes by analyzing the interactomes underlying these diseases. The platform makes possible large-scale prediction and curation protein interactions using the conservation of motifs, interology, or presence or absence of key sequence signatures. The range of structure-based tools includes modeling and analysis of protein complexes, delineation of interfaces and the modeling of peptides acting as inhibitors of protein–protein interactions. Galaxy InteractoMIX includes a range of ready-to-use workflows to run complex analyses requiring minimal intervention by users. The potential range of applications of the platform covers different aspects of life science, biomedicine, biotechnology and drug discovery where protein associations are studied.

  • Název v anglickém jazyce

    Galaxy InteractoMIX: An Integrated Computational Platform for the Study of Protein–Protein Interaction Data

  • Popis výsledku anglicky

    Protein interactions play a crucial role among the different functions of a cell and are central to our understanding of cellular processes both in health and disease. Here we present Galaxy InteractoMIX (http://galaxy.interactomix.com), a platform composed of 13 different computational tools each addressing specific aspects of the study of protein–protein interactions, ranging from large-scale cross-species protein-wide interactomes to atomic resolution level of protein complexes. Galaxy InteractoMIX provides an intuitive interface where users can retrieve consolidated interactomics data distributed across several databases or uncover links between diseases and genes by analyzing the interactomes underlying these diseases. The platform makes possible large-scale prediction and curation protein interactions using the conservation of motifs, interology, or presence or absence of key sequence signatures. The range of structure-based tools includes modeling and analysis of protein complexes, delineation of interfaces and the modeling of peptides acting as inhibitors of protein–protein interactions. Galaxy InteractoMIX includes a range of ready-to-use workflows to run complex analyses requiring minimal intervention by users. The potential range of applications of the platform covers different aspects of life science, biomedicine, biotechnology and drug discovery where protein associations are studied.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_027%2F0008360" target="_blank" >EF16_027/0008360: Postdoc@MUNI</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Molecular Biology

  • ISSN

    0022-2836

  • e-ISSN

    1089-8638

  • Svazek periodika

    433

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    166656

  • Kód UT WoS článku

    000648520800004

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85091901427