Transkriptomický profil interakce terapeutického bakteriofága z rodu Kayvirus s bakterií Staphylococcus aureus

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F22%3A00129743" target="_blank" >RIV/00216224:14310/22:00129743 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Transkriptomický profil interakce terapeutického bakteriofága z rodu Kayvirus s bakterií Staphylococcus aureus

Popis výsledku v původním jazyce

Léčba lidských i zvířecích onemocnění způsobených patogenní bakterií Staphylococcus aureus se stává stále komplikovanější kvůli zvyšující se rezistenci k antimikrobiálním látkám. Alternativou k antibiotikům, která jsou v současné době využívána v léčbě stafylokokových infekcí, jsou lytické bakteriofágy z rodu Kayvirus, avšak jejich rozsáhlejší využití je omezeno nedostatkem informací o interakci fága a jeho hostitele na molekulární úrovni. V prezentované studii byly dva kmeny S. aureus infikovány kayvirem bakteriofágem K a pomocí metody RNA sekvenování byly sledovány změny exprese fágových i bakteriálních genů v průběhu infekce. Transkripční profil v průběhu životního cyklu fága byl srovnatelný u obou kmenů s výjimkou několika málo genů kódujících hypotetické proteiny. Data z RNA sekvenování taktéž ukázala na přítomnost fágových nekódujících RNA, které by mohly mít vliv na expresi fágových i bakteriálních genů. Odpověď hostitele na infekci fágem připomínala na transkriptomické úrovni obecnou odpověď bakterie na stres. U obou kmenů S. aureus se zvýšila exprese genů pro syntézu nukleotidů, aminokyselin, transportních proteinů a energetického metabolismu a současně bylo pozorováno snížení exprese genů pro tři bakteriální transkripční faktory. Získané výsledky objasňují interakci fága a hostitele na transkripční úrovni a významně přispívají k bezpečnějšímu použití fágů v terapii a odkrývají možnosti vývoje nových strategií pro eradikaci bakteriálních patogenů.

Název v anglickém jazyce

Transcriptomic profile of the interaction of a Kayvirus therapeutic bacteriophage with Staphylococcus aureus

Popis výsledku anglicky

The treatment of human and animal diseases caused by pathogenic bacteria Staphylococcus aureus is becoming increasingly complicated due to increasing antimicrobial resistance. An alternative to antibiotics currently used to treat staphylococcal infections is phage treatment by bacteriophages from the genus Kayvirus. Still, their wider use is limited by the need for more information on the interaction between the phage and its host at the molecular level. In the presented study, two strains of S. aureus were infected with kayvirus bacteriophage K. Changes in phage and bacterial gene expression during infection were monitored using RNA sequencing. The transcriptional profile during the phage life cycle was comparable in both strains, except for a few genes encoding hypothetical proteins. Data from RNA sequencing also indicated the presence of phage non-coding RNAs that could influence the expression of both phage and bacterial genes. The host response to phage infection resembled the general bacterial stress response at the transcriptomic level. In both strains of S. aureus, the expression of genes for nucleotide synthesis, amino acid synthesis, transport proteins and energy metabolism increased. At the same time, a decrease in the expression of genes for three bacterial transcription factors was observed. The obtained results clarify the phage-host interaction at the transcriptional level, significantly contribute to the safer use of phages in therapy, and reveal the possibilities of developing new strategies for eradicating bacterial pathogens.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/NU22-05-00042" target="_blank" >NU22-05-00042: Vývoj nových nanobiotechnologií pro sledování terapeutických bakteriofágů v klinických vzorcích</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů