RIAssigner: A package for gas chromatographic retention index calculation
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F22%3A00135035" target="_blank" >RIV/00216224:14310/22:00135035 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.04337" target="_blank" >https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.04337</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.21105/joss.04337" target="_blank" >10.21105/joss.04337</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
RIAssigner: A package for gas chromatographic retention index calculation
Popis výsledku v původním jazyce
RIAssigner is a software package for the computation of gas chromatographic (GC) retention indices (RI). The package uses matchms (Huber et al., 2020) and pandas (The pandas development team, 2020) for data I/O and supports the .msp as well as tabular (.csv & .tsv) formats, among others. It supports multiple keywords identifying the retention time (RT) and RI information and handling SI units for RT. The RI can be computed using non-isothermal Kováts retention-indexing (from temperature programming, using the definition of van Den Dool & Kratz (1963)) or cubic spline interpolation (Halang et al., 1978) based on a reference dataset containing RT & RI. The MIT-licensed package is hosted via bioconda (Grüning et al., 2018) and is also accessible to users as a Galaxy tool (Jalili et al., 2020; Spectrometric Data Processing and Analysis & Institute of Computer Science, 2022).
Název v anglickém jazyce
RIAssigner: A package for gas chromatographic retention index calculation
Popis výsledku anglicky
RIAssigner is a software package for the computation of gas chromatographic (GC) retention indices (RI). The package uses matchms (Huber et al., 2020) and pandas (The pandas development team, 2020) for data I/O and supports the .msp as well as tabular (.csv & .tsv) formats, among others. It supports multiple keywords identifying the retention time (RT) and RI information and handling SI units for RT. The RI can be computed using non-isothermal Kováts retention-indexing (from temperature programming, using the definition of van Den Dool & Kratz (1963)) or cubic spline interpolation (Halang et al., 1978) based on a reference dataset containing RT & RI. The MIT-licensed package is hosted via bioconda (Grüning et al., 2018) and is also accessible to users as a Galaxy tool (Jalili et al., 2020; Spectrometric Data Processing and Analysis & Institute of Computer Science, 2022).
Klasifikace
Druh
J<sub>ost</sub> - Ostatní články v recenzovaných periodicích
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2022
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Open Source Software
ISSN
2475-9066
e-ISSN
—
Svazek periodika
7
Číslo periodika v rámci svazku
75
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
1-4
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—