SBILib: a handle for protein modeling and engineering

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F23%3A00132020" target="_blank" >RIV/00216224:14310/23:00132020 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00159816:_____/23:00081783

Výsledek na webu

<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article/39/10/btad613/7291855?login=true" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article/39/10/btad613/7291855?login=true</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btad613" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btad613</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

SBILib: a handle for protein modeling and engineering

Popis výsledku v původním jazyce

The SBILib Python library provides an integrated platform for the analysis of macromolecular structures and interactions. It combines simple 3D file parsing and workup methods with more advanced analytical tools. SBILib includes modules for macromolecular interactions, loops, super-secondary structures, and biological sequences, as well as wrappers for external tools with which to integrate their results and facilitate the comparative analysis of protein structures and their complexes. The library can handle macromolecular complexes formed by proteins and/or nucleic acid molecules (i.e. DNA and RNA). It is uniquely capable of parsing and calculating protein super-secondary structure and loop geometry. We have compiled a list of example scenarios which SBILib may be applied to and provided access to these within the library.

Název v anglickém jazyce

SBILib: a handle for protein modeling and engineering

Popis výsledku anglicky

The SBILib Python library provides an integrated platform for the analysis of macromolecular structures and interactions. It combines simple 3D file parsing and workup methods with more advanced analytical tools. SBILib includes modules for macromolecular interactions, loops, super-secondary structures, and biological sequences, as well as wrappers for external tools with which to integrate their results and facilitate the comparative analysis of protein structures and their complexes. The library can handle macromolecular complexes formed by proteins and/or nucleic acid molecules (i.e. DNA and RNA). It is uniquely capable of parsing and calculating protein super-secondary structure and loop geometry. We have compiled a list of example scenarios which SBILib may be applied to and provided access to these within the library.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10609 - Biochemical research methods

Projekt

<a href="/cs/project/LX22NPO5102" target="_blank" >LX22NPO5102: Národní ústav pro výzkum rakoviny</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Bioinformatics

ISSN

1367-4803

e-ISSN

1367-4811

Svazek periodika

39

Číslo periodika v rámci svazku

10

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

1-3

Kód UT WoS článku

001188979400013

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85175741224