Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Transcriptome and proteome associated analysis of flavonoid metabolism in haploid Ginkgo biloba

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F23%3A00134043" target="_blank" >RIV/00216224:14310/23:00134043 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.10.125" target="_blank" >https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.10.125</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.10.125" target="_blank" >10.1016/j.ijbiomac.2022.10.125</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Transcriptome and proteome associated analysis of flavonoid metabolism in haploid Ginkgo biloba

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Having different number if genome copies affect transcription and metabolite production of plants. This may be due to different gene transcription and protein expression, but the reasons for this remains poorly known. Here we measured flavonoid content in leaves of three haploid and diploid grafted plants of Ginkgo biloba, a model gymnosperm important economically for its flavonoid content. We reported the first combined transcriptomic and proteomic analysis of the difference in flavonoid content in three haploid ginkgos to investigate the effect of haploidy. Haploids had always smaller leaves and flavonoid content than the diploids. The selected haploid had also generally lower gene dosage than the selected diploid, with 1149 up-regulated (46.8 %) and 1309 down-regulated (53.2 %) among 2452 differentially expressed genes (DEGs). Of 686 differentially expressed proteins (DEPs) detected, 289 proteins (42.1 %) were upregulated, and 397 proteins (57.9 %) were downregulated in haploids. A particular attention deserves the downregulation of PAL, PAM, FLS, OMT1 hub genes involved in flavonoid biosynthesis regulation. Our study confirms the trend of haploids to have lower metabolic contents and points that lower flavonoid content in ginkgo monoploids could be due to reduced dosage of the corresponding regulatory genes and downregulation of genes involved in flavonoid synthesis.

  • Název v anglickém jazyce

    Transcriptome and proteome associated analysis of flavonoid metabolism in haploid Ginkgo biloba

  • Popis výsledku anglicky

    Having different number if genome copies affect transcription and metabolite production of plants. This may be due to different gene transcription and protein expression, but the reasons for this remains poorly known. Here we measured flavonoid content in leaves of three haploid and diploid grafted plants of Ginkgo biloba, a model gymnosperm important economically for its flavonoid content. We reported the first combined transcriptomic and proteomic analysis of the difference in flavonoid content in three haploid ginkgos to investigate the effect of haploidy. Haploids had always smaller leaves and flavonoid content than the diploids. The selected haploid had also generally lower gene dosage than the selected diploid, with 1149 up-regulated (46.8 %) and 1309 down-regulated (53.2 %) among 2452 differentially expressed genes (DEGs). Of 686 differentially expressed proteins (DEPs) detected, 289 proteins (42.1 %) were upregulated, and 397 proteins (57.9 %) were downregulated in haploids. A particular attention deserves the downregulation of PAL, PAM, FLS, OMT1 hub genes involved in flavonoid biosynthesis regulation. Our study confirms the trend of haploids to have lower metabolic contents and points that lower flavonoid content in ginkgo monoploids could be due to reduced dosage of the corresponding regulatory genes and downregulation of genes involved in flavonoid synthesis.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10611 - Plant sciences, botany

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA19-18545S" target="_blank" >GA19-18545S: Eko-geografická limitace rostlinných polyploidů: experimentální testování nových hypotéz souvisejících s velikostí buněk</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Biological Macromolecules

  • ISSN

    0141-8130

  • e-ISSN

    1879-0003

  • Svazek periodika

    224

  • Číslo periodika v rámci svazku

    January

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    306-318

  • Kód UT WoS článku

    000906782900001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85143996371