Distribution patterns of LTR retrotransposons in monocentric and holocentric chromosomes
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F25%3A00141157" target="_blank" >RIV/00216224:14310/25:00141157 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Distribution patterns of LTR retrotransposons in monocentric and holocentric chromosomes
Popis výsledku v původním jazyce
Transposable elements can constitute a significant fraction of eukaryotic genomes, with long terminal repeat retrotransposons (LTR-RTs) being particularly prevalent in plants. In monocentric chromosomes (with localized centromere), recombination rates vary along chromosome, with suppression in pericentromeric and other heterochromatic regions. LTR-RTs may "hide" in these recombination cold regions. In contrast, holocentric chromosomes (lacking a single localized centromere) exhibit a more uniform chromatin structure without evident euchromatic or heterochromatic clusters. Therefore, recombination may be more or less homogeneously distributed along holocentric chromosomes, making it difficult for LTR-RTs to evade removal. We hypothesize that this uniform recombination facilitates a more even removal of LTR-RTs in holocentric chromosomes compared to monocentric chromosomes.
Název v anglickém jazyce
Distribution patterns of LTR retrotransposons in monocentric and holocentric chromosomes
Popis výsledku anglicky
Transposable elements can constitute a significant fraction of eukaryotic genomes, with long terminal repeat retrotransposons (LTR-RTs) being particularly prevalent in plants. In monocentric chromosomes (with localized centromere), recombination rates vary along chromosome, with suppression in pericentromeric and other heterochromatic regions. LTR-RTs may "hide" in these recombination cold regions. In contrast, holocentric chromosomes (lacking a single localized centromere) exhibit a more uniform chromatin structure without evident euchromatic or heterochromatic clusters. Therefore, recombination may be more or less homogeneously distributed along holocentric chromosomes, making it difficult for LTR-RTs to evade removal. We hypothesize that this uniform recombination facilitates a more even removal of LTR-RTs in holocentric chromosomes compared to monocentric chromosomes.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA24-11400S" target="_blank" >GA24-11400S: Příčiny a důsledky evoluce frekvence rekombinace u eukaryotických linií lišících se typem chromozomů</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2025
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů