Rozpoznavani sekundarni struktury proteinu metodami strojoveho uceni

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F05%3A00014719" target="_blank" >RIV/00216224:14330/05:00014719 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Protein Secondary Structure Prediction by Machine Learning Methods

Popis výsledku v původním jazyce

This paper concerns about an application of machine learning methods to a prediction of a secondary structure of an unknown protein. The aim of this study is to the compare artificial neural networks as the state of art method with decision trees and naive Bayes classifier. Detailed experiments are done on selected PDB database data. Results shows that decision trees achieving 87.4 % Q3 accuracy outperform neural networks (80.5 %). Naive Bayes classifier is unusable for this task.

Název v anglickém jazyce

Protein Secondary Structure Prediction by Machine Learning Methods

Popis výsledku anglicky

This paper concerns about an application of machine learning methods to a prediction of a secondary structure of an unknown protein. The aim of this study is to the compare artificial neural networks as the state of art method with decision trees and naive Bayes classifier. Detailed experiments are done on selected PDB database data. Results shows that decision trees achieving 87.4 % Q3 accuracy outperform neural networks (80.5 %). Naive Bayes classifier is unusable for this task.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

1st International Summer School on Computational Biology

ISBN

80-210-3907-8

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

38-43

Název nakladatele

Masaryk University

Místo vydání

Brno, Czech Republic

Místo konání akce

Brno, Czech Republic

Datum konání akce

4. 9. 2005

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—