A Two-Phase Segmentation of Cell Nuclei Using Fast Level Set-Like Algorithms

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F09%3A00034316" target="_blank" >RIV/00216224:14330/09:00034316 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14330/09:00067108

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

A Two-Phase Segmentation of Cell Nuclei Using Fast Level Set-Like Algorithms

Popis výsledku v původním jazyce

An accurate localization of a cell nucleus boundary is inevitable for any further quantitative analysis of various subnuclear structures within the cell nucleus. In this paper, we present a novel approach to the cell nucleus segmentation in fluorescencemicroscope images exploiting the level set framework. The proposed method works in two phases. In the first phase, the image foreground is separated from the background using a fast level set-like algorithm by Nilsson and Heyden (2003). A binary mask ofisolated cell nuclei as well as their clusters is obtained as a result of the first phase. A fast topology-preserving level set-like algorithm by Maška and Matula (2008) is applied in the second phase to delineate individual cell nuclei within the clusters. The potential of the new method is demonstrated on images of DAPI-stained nuclei of a lung cancer cell line A549 and promyelocytic leukemia cell line HL60.

Název v anglickém jazyce

A Two-Phase Segmentation of Cell Nuclei Using Fast Level Set-Like Algorithms

Popis výsledku anglicky

An accurate localization of a cell nucleus boundary is inevitable for any further quantitative analysis of various subnuclear structures within the cell nucleus. In this paper, we present a novel approach to the cell nucleus segmentation in fluorescencemicroscope images exploiting the level set framework. The proposed method works in two phases. In the first phase, the image foreground is separated from the background using a fast level set-like algorithm by Nilsson and Heyden (2003). A binary mask ofisolated cell nuclei as well as their clusters is obtained as a result of the first phase. A fast topology-preserving level set-like algorithm by Maška and Matula (2008) is applied in the second phase to delineate individual cell nuclei within the clusters. The potential of the new method is demonstrated on images of DAPI-stained nuclei of a lung cancer cell line A549 and promyelocytic leukemia cell line HL60.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

16th Scandinavian Conference on Image Analysis

ISBN

978-3-642-02229-6

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

—

Název nakladatele

Springer-Verlag

Místo vydání

Berlin, Heidelberg

Místo konání akce

Oslo

Datum konání akce

15. 6. 2009

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

000268661000040