CAVER Viewer-new tool enhancing computation and visualization of channels in proteins

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F10%3A00044485" target="_blank" >RIV/00216224:14330/10:00044485 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

CAVER Viewer-new tool enhancing computation and visualization of channels in proteins

Popis výsledku v původním jazyce

In this article, we describe the CAVER Viewer as the next tile in the mosaic of protein visualization programs. CAVER Viewer provides enhanced interface for channel analysis and a set of traditional and new techniques for visualization of the results. With the CAVER Viewer, users can explore specific paths in protein structure, which are called channels. Channels may be explored in the three-dimensional space of the molecule using the two-dimensional information and statistics, visualized as 2D graphs and connected with the 3D displaying window. In comparison to the existing applications, our program also enables working with large data sets obtained from dynamic simulations of protein behavior.

Název v anglickém jazyce

CAVER Viewer-new tool enhancing computation and visualization of channels in proteins

Popis výsledku anglicky

In this article, we describe the CAVER Viewer as the next tile in the mosaic of protein visualization programs. CAVER Viewer provides enhanced interface for channel analysis and a set of traditional and new techniques for visualization of the results. With the CAVER Viewer, users can explore specific paths in protein structure, which are called channels. Channels may be explored in the three-dimensional space of the molecule using the two-dimensional information and statistics, visualized as 2D graphs and connected with the 3D displaying window. In comparison to the existing applications, our program also enables working with large data sets obtained from dynamic simulations of protein behavior.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

The IADIS Computer Graphics, Visualization, Computer Vision and Image Processing (CGVCVIP) 2010

ISBN

978-972-8939-22-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

—

Název nakladatele

IADIS Press

Místo vydání

Neuveden

Místo konání akce

Freiburg, Germany

Datum konání akce

27. 7. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—