CytoPacq v2.0

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F13%3A00066205" target="_blank" >RIV/00216224:14330/13:00066205 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

CytoPacq v2.0

Popis výsledku v původním jazyce

CytoPacq v2.0 is nontrivial extension of CytoPacq toolkit developed in 2009. Newly, the distribution of cell nuclei within the specimen can be controlled by the user. The phenomenon called uneven illumination is now based on extensive experimental measurements. The computational kernel, which is located on server-side, is now more robust and offer better communication user interface. Namely, the user is notified via e-mail if something important happens (simulation failure, simulation completed, waitingfor user input). Moreover, the user can interrupt the computation. The application also offers sample large pre-generated image dataset (68 GB) which is free to use.

Název v anglickém jazyce

CytoPacq v2.0

Popis výsledku anglicky

CytoPacq v2.0 is nontrivial extension of CytoPacq toolkit developed in 2009. Newly, the distribution of cell nuclei within the specimen can be controlled by the user. The phenomenon called uneven illumination is now based on extensive experimental measurements. The computational kernel, which is located on server-side, is now more robust and offer better communication user interface. Namely, the user is notified via e-mail if something important happens (simulation failure, simulation completed, waitingfor user input). Moreover, the user can interrupt the computation. The application also offers sample large pre-generated image dataset (68 GB) which is free to use.

Druh

R - Software

CEP obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GBP302%2F12%2FG157" target="_blank" >GBP302/12/G157: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

2.0

Technické parametry

Pro využití softwaru je nutné postupovat podle licence GNU GPL v3. Odpovědná osoba pro jednání: David Svoboda, Fakulta informatiky, Masarykova univerzita, Botanická 68a, Brno, 602 00, svoboda@mail.muni.cz, tel. 549494383

Ekonomické parametry

zvýšení kvality generovaných syntetických biomedicínských obrazových dat, která se následně používají pro validaci segmentačních či trackovacích algoritmů při automatizovaném zpracování obrazu

IČO vlastníka výsledku

00216224

Název vlastníka

Masarykova univerzita