Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F14%3A00076022" target="_blank" >RIV/00216224:14330/14:00076022 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2014.06.013" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2014.06.013</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2014.06.013" target="_blank" >10.1016/j.entcs.2014.06.013</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models

Popis výsledku v původním jazyce

In this tool paper, we target the problem of unique annotation of organism-specific computational models presented in a public model database. In particular, we present Biochemical Space, a novel annotation methodology accompanied with a set of softwaretools that allow to create, manage and maintain the Biochemical Space content. The main idea behind is to create a transparent well-annotated reaction network of chemical entities and elemental reactions onto which the mathematical models are projected.For a given organism, the Biochemical Space represents a unifying platform for understanding of the related biological processes.

Název v anglickém jazyce

Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models

Popis výsledku anglicky

In this tool paper, we target the problem of unique annotation of organism-specific computational models presented in a public model database. In particular, we present Biochemical Space, a novel annotation methodology accompanied with a set of softwaretools that allow to create, manage and maintain the Biochemical Space content. The main idea behind is to create a transparent well-annotated reaction network of chemical entities and elemental reactions onto which the mathematical models are projected.For a given organism, the Biochemical Space represents a unifying platform for understanding of the related biological processes.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/EE2.3.20.0256" target="_blank" >EE2.3.20.0256: Vytvoření výzkumného týmu a mezinárodního konzorcia pro počítačový model buňky sinice</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Proceedings of the 5th International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio?14)

ISBN

—

ISSN

1571-0661

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

31-44

Název nakladatele

Elsevier

Místo vydání

Amsterdam

Místo konání akce

Berlin

Datum konání akce

1. 1. 2014

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—