Formal Biochemical Space with Semantics in Kappa and BNGL

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F16%3A00088812" target="_blank" >RIV/00216224:14330/16:00088812 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2016.09.017" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2016.09.017</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2016.09.017" target="_blank" >10.1016/j.entcs.2016.09.017</a>

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Formal Biochemical Space with Semantics in Kappa and BNGL
Popis výsledku v původním jazyce
Biochemical Space (BCS) has been introduced as a semi-formal notation for reaction networks of biological processes. It provides a concise mapping of mathematical models to their biological description established at a desired level of abstraction. In this paper, we first turn BCS into a completely formal language with rigorously defined semantics by means of a simplified Kappa calculus. On the practical end, we support BCS with translation to BNGL, a well-known practically used rule-based language. Finally, we show the current status of BCS defined for cyanobacteria processes.
Název v anglickém jazyce
Formal Biochemical Space with Semantics in Kappa and BNGL
Popis výsledku anglicky
Biochemical Space (BCS) has been introduced as a semi-formal notation for reaction networks of biological processes. It provides a concise mapping of mathematical models to their biological description established at a desired level of abstraction. In this paper, we first turn BCS into a completely formal language with rigorously defined semantics by means of a simplified Kappa calculus. On the practical end, we support BCS with translation to BNGL, a well-known practically used rule-based language. Finally, we show the current status of BCS defined for cyanobacteria processes.

Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku
The 6th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology, SASB 2015
ISBN
—
ISSN
1571-0661
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
23
Strana od-do
27-49
Název nakladatele
Elsevier
Místo vydání
Neuveden
Místo konání akce
Saint Malo
Datum konání akce
1. 1. 2015
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—

Podobné výsledky(10)