Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14610%2F20%3A00120596" target="_blank" >RIV/00216224:14610/20:00120596 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.9b01032" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.9b01032</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.9b01032" target="_blank" >10.1021/acs.jcim.9b01032</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion
Popis výsledku v původním jazyce
Advances in cryo-electron microscopy (cryo-EM) have made it possible to obtain structures of large biological macromolecules at near-atomic resolution. This "resolution revolution" has encouraged the use and development of modeling tools able to produce high-quality atomic models from cryo-EM density maps. Unfortunately, many practical problems appear when combining different packages in the same processing workflow, which make difficult the use of these tools by non-experts and, therefore, reduce their utility. We present here a major extension of the image processing framework Scipion that provides inter-package integration in the model building area and full tracking of the complete workflow, from image processing to structure validation.
Název v anglickém jazyce
Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion
Popis výsledku anglicky
Advances in cryo-electron microscopy (cryo-EM) have made it possible to obtain structures of large biological macromolecules at near-atomic resolution. This "resolution revolution" has encouraged the use and development of modeling tools able to produce high-quality atomic models from cryo-EM density maps. Unfortunately, many practical problems appear when combining different packages in the same processing workflow, which make difficult the use of these tools by non-experts and, therefore, reduce their utility. We present here a major extension of the image processing framework Scipion that provides inter-package integration in the model building area and full tracking of the complete workflow, from image processing to structure validation.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10400 - Chemical sciences
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
R - Projekt Ramcoveho programu EK
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Chemical Information and Modeling
ISSN
1549-9596
e-ISSN
1549-960X
Svazek periodika
60
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
2533-2540
Kód UT WoS článku
000537653400016
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85085264081