Charge Profile Analysis Reveals That Activation of Pro-apoptotic Regulators Bax and Bak Relies on Charge Transfer Mediated Allosteric Regulation
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F12%3A00057573" target="_blank" >RIV/00216224:14740/12:00057573 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1002565" target="_blank" >http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1002565</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002565" target="_blank" >10.1371/journal.pcbi.1002565</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Charge Profile Analysis Reveals That Activation of Pro-apoptotic Regulators Bax and Bak Relies on Charge Transfer Mediated Allosteric Regulation
Popis výsledku v původním jazyce
The pro-apoptotic proteins Bax and Bak are essential for executing programmed cell death (apoptosis), yet the mechanism of their activation is not properly understood at the structural level. For the first time in cell death research, we calculated intra-protein charge transfer in order to study the structural alterations and their functional consequences during Bax activation. Using an electronegativity equalization model, we investigated the changes in the Bax charge profile upon activation by a functional peptide of its natural activator protein, Bim. We found that charge reorganizations upon activator binding mediate the exposure of the functional sites of Bax, rendering Bax active. The affinity of the Bax C-domain for its binding groove is decreased due to the Arg94-mediated abrogation of the Ser184-Asp98 interaction.
Název v anglickém jazyce
Charge Profile Analysis Reveals That Activation of Pro-apoptotic Regulators Bax and Bak Relies on Charge Transfer Mediated Allosteric Regulation
Popis výsledku anglicky
The pro-apoptotic proteins Bax and Bak are essential for executing programmed cell death (apoptosis), yet the mechanism of their activation is not properly understood at the structural level. For the first time in cell death research, we calculated intra-protein charge transfer in order to study the structural alterations and their functional consequences during Bax activation. Using an electronegativity equalization model, we investigated the changes in the Bax charge profile upon activation by a functional peptide of its natural activator protein, Bim. We found that charge reorganizations upon activator binding mediate the exposure of the functional sites of Bax, rendering Bax active. The affinity of the Bax C-domain for its binding groove is decreased due to the Arg94-mediated abrogation of the Ser184-Asp98 interaction.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PLoS Computational Biology
ISSN
1553-7358
e-ISSN
—
Svazek periodika
8
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000305965300033
EID výsledku v databázi Scopus
—