Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F12%3A00057639" target="_blank" >RIV/00216224:14740/12:00057639 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://nar.oxfordjournals.org/content/40/22/11748.full-text-lowres.pdf" target="_blank" >http://nar.oxfordjournals.org/content/40/22/11748.full-text-lowres.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks929" target="_blank" >10.1093/nar/gks929</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3

Popis výsledku v původním jazyce

Asymmetric dimethylarginine (aDMA) marks are placed on histones and the C-terminal domain (CTD) of RNA Polymerase II (RNAP II) and serve as a signal for recruitment of appropriate transcription and processing factors in coordination with transcription cycle. In contrast to other Tudor domain-containing proteins, Tudor domain-containing protein 3 (TDRD3) associates selectively with the aDMA marks but not with other methylarginine motifs. Here, we report the solution structure of the Tudor domain of TDRD3bound to the asymmetrically dimethylated CTD. The structure and mutational analysis provide a molecular basis for how TDRD3 recognizes the aDMA mark. The unique aromatic cavity of the TDRD3 Tudor domain with a tyrosine in position 566 creates a selectivity filter for the aDMA residue. Our work contributes to the understanding of substrate selectivity rules of the Tudor aromatic cavity, which is an important structural motif for reading of methylation marks.

Název v anglickém jazyce

Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3

Popis výsledku anglicky

Asymmetric dimethylarginine (aDMA) marks are placed on histones and the C-terminal domain (CTD) of RNA Polymerase II (RNAP II) and serve as a signal for recruitment of appropriate transcription and processing factors in coordination with transcription cycle. In contrast to other Tudor domain-containing proteins, Tudor domain-containing protein 3 (TDRD3) associates selectively with the aDMA marks but not with other methylarginine motifs. Here, we report the solution structure of the Tudor domain of TDRD3bound to the asymmetrically dimethylated CTD. The structure and mutational analysis provide a molecular basis for how TDRD3 recognizes the aDMA mark. The unique aromatic cavity of the TDRD3 Tudor domain with a tyrosine in position 566 creates a selectivity filter for the aDMA residue. Our work contributes to the understanding of substrate selectivity rules of the Tudor aromatic cavity, which is an important structural motif for reading of methylation marks.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Nucleic Acids Research

ISSN

0305-1048

e-ISSN

—

Svazek periodika

40

Číslo periodika v rámci svazku

22

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

11748-11755

Kód UT WoS článku

000313414800056

EID výsledku v databázi Scopus

—