Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F13%3A00066451" target="_blank" >RIV/00216224:14740/13:00066451 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.plantcell.org/content/early/2013/05/06/tpc.113.110486.abstract" target="_blank" >http://www.plantcell.org/content/early/2013/05/06/tpc.113.110486.abstract</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.110486" target="_blank" >10.1105/tpc.113.110486</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa
Popis výsledku v původním jazyce
The genus Brassica includes several important agricultural and horticultural crops. Their current genome structures were shaped by whole-genome triplication followed by extensive diploidization. The availability of several crucifer genome sequences, especially that of Chinese cabbage (Brassica rapa), enables study of the evolution of the mesohexaploid Brassica genomes from their diploid progenitors. We reconstructed three ancestral subgenomes of B. rapa (n = 10) by comparing its whole-genome sequence toancestral and extant Brassicaceae genomes. All three B. rapa paleogenomes apparently consisted of seven chromosomes, similar to the ancestral translocation Proto-Calepineae Karyotype (tPCK; n = 7), which is the evolutionarily younger variant of the Proto-Calepineae Karyotype (n = 7).
Název v anglickém jazyce
Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa
Popis výsledku anglicky
The genus Brassica includes several important agricultural and horticultural crops. Their current genome structures were shaped by whole-genome triplication followed by extensive diploidization. The availability of several crucifer genome sequences, especially that of Chinese cabbage (Brassica rapa), enables study of the evolution of the mesohexaploid Brassica genomes from their diploid progenitors. We reconstructed three ancestral subgenomes of B. rapa (n = 10) by comparing its whole-genome sequence toancestral and extant Brassicaceae genomes. All three B. rapa paleogenomes apparently consisted of seven chromosomes, similar to the ancestral translocation Proto-Calepineae Karyotype (tPCK; n = 7), which is the evolutionarily younger variant of the Proto-Calepineae Karyotype (n = 7).
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Cell
ISSN
1040-4651
e-ISSN
—
Svazek periodika
25
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
1541-1554
Kód UT WoS článku
000321035800009
EID výsledku v databázi Scopus
—