Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Complex patterns of chromosome 11 aberrations in myeloid malignancies target CBL, MLL, DDB1 and LMO2

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F13%3A00070753" target="_blank" >RIV/00216224:14740/13:00070753 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/65269705:_____/13:#0002208

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0077819" target="_blank" >http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0077819</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0077819" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0077819</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Complex patterns of chromosome 11 aberrations in myeloid malignancies target CBL, MLL, DDB1 and LMO2

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Exome sequencing of primary tumors identifies complex somatic mutation patterns. Assignment of relevance of individual somatic mutations is difficult and poses the next challenge for interpretation of next generation sequencing data. Here we present an approach how exome sequencing in combination with SNP microarray data may identify targets of chromosomal aberrations in myeloid malignancies. The rationale of this approach is that hotspots of chromosomal aberrations might also harbor point mutations inthe target genes of deletions, gains or uniparental disomies (UPDs). Chromosome 11 is a frequent target of lesions in myeloid malignancies. Therefore, we studied chromosome 11 in a total of 813 samples from 773 individual patients with different myeloidmalignancies by SNP microarrays and complemented the data with exome sequencing in selected cases exhibiting chromosome 11 defects. We found gains, losses and UPDs of chromosome 11 in 52 of the 813 samples (6.4%).

  • Název v anglickém jazyce

    Complex patterns of chromosome 11 aberrations in myeloid malignancies target CBL, MLL, DDB1 and LMO2

  • Popis výsledku anglicky

    Exome sequencing of primary tumors identifies complex somatic mutation patterns. Assignment of relevance of individual somatic mutations is difficult and poses the next challenge for interpretation of next generation sequencing data. Here we present an approach how exome sequencing in combination with SNP microarray data may identify targets of chromosomal aberrations in myeloid malignancies. The rationale of this approach is that hotspots of chromosomal aberrations might also harbor point mutations inthe target genes of deletions, gains or uniparental disomies (UPDs). Chromosome 11 is a frequent target of lesions in myeloid malignancies. Therefore, we studied chromosome 11 in a total of 813 samples from 773 individual patients with different myeloidmalignancies by SNP microarrays and complemented the data with exome sequencing in selected cases exhibiting chromosome 11 defects. We found gains, losses and UPDs of chromosome 11 in 52 of the 813 samples (6.4%).

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    FD - Onkologie a hematologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/ED1.1.00%2F02.0068" target="_blank" >ED1.1.00/02.0068: CEITEC - central european institute of technology</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2013

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLOS ONE

  • ISSN

    1932-6203

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    8

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000326019400137

  • EID výsledku v databázi Scopus