The influence of culture conditions on the identification of Mycobacterium species by MALDI-TOF MS profiling
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F14%3A00073252" target="_blank" >RIV/00216224:14740/14:00073252 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00027162:_____/14:#0001094
Výsledek na webu
<a href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1574-6968.12408/epdf" target="_blank" >http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1574-6968.12408/epdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/1574-6968.12408" target="_blank" >10.1111/1574-6968.12408</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The influence of culture conditions on the identification of Mycobacterium species by MALDI-TOF MS profiling
Popis výsledku v původním jazyce
Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) represents a simple reliable approach for rapid bacterial identification based on specific peptide/protein fingerprints. However, cell-wall characteristics of mycobacterial species, and their well known stability, complicate MALDI-TOF MS profiling analysis. In this study, we tested two recently published protocols for inactivation and disruption of mycobacteria, and we also examined the influence of different culture conditions (four culture media and five cultivation times) on mass spectral quality and the discriminatory power of the method. We found a significant influence of sample pretreatment method and culture medium on species identification and differentiation for a total of 10 strains belonging to Mycobacterium phlei and Mycobacteriumsmegmatis.
Název v anglickém jazyce
The influence of culture conditions on the identification of Mycobacterium species by MALDI-TOF MS profiling
Popis výsledku anglicky
Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) represents a simple reliable approach for rapid bacterial identification based on specific peptide/protein fingerprints. However, cell-wall characteristics of mycobacterial species, and their well known stability, complicate MALDI-TOF MS profiling analysis. In this study, we tested two recently published protocols for inactivation and disruption of mycobacteria, and we also examined the influence of different culture conditions (four culture media and five cultivation times) on mass spectral quality and the discriminatory power of the method. We found a significant influence of sample pretreatment method and culture medium on species identification and differentiation for a total of 10 strains belonging to Mycobacterium phlei and Mycobacteriumsmegmatis.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
FEMS Microbiology Letters
ISSN
0378-1097
e-ISSN
—
Svazek periodika
353
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
77-84
Kód UT WoS článku
000333654500011
EID výsledku v databázi Scopus
—