Exploring non-covalent interactions in guanine- and xanthine-based model DNA quadruplex structures: A comprehensive quantum chemical approach

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F14%3A00074812" target="_blank" >RIV/00216224:14740/14:00074812 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1039/C3CP53875C" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1039/C3CP53875C</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1039/C3CP53875C" target="_blank" >10.1039/C3CP53875C</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Exploring non-covalent interactions in guanine- and xanthine-based model DNA quadruplex structures: A comprehensive quantum chemical approach

Popis výsledku v původním jazyce

The study aimed to cast light on the structure and internal energetics of guanine- and xanthine-based model DNA quadruplexes and the physico-chemical nature of the non-covalent interactions involved. Several independent approaches were used for this purpose: DFT-D3 calculations, Quantum Theory of Atoms in Molecules, Natural Bond Orbital Analysis, Energy Decomposition Analysis, Compliance Constant Theory, and Non-Covalent Interaction Analysis. The results point to an excellent degree of structural and energetic compatibility between the two types of model quadruplexes. This fact stems from both the structural features (close values of van der Waals volumes, pore radii, geometrical parameters of the H-bonds) and the energetic characteristics (comparablevalues of the energies of formation).

Název v anglickém jazyce

Exploring non-covalent interactions in guanine- and xanthine-based model DNA quadruplex structures: A comprehensive quantum chemical approach

Popis výsledku anglicky

The study aimed to cast light on the structure and internal energetics of guanine- and xanthine-based model DNA quadruplexes and the physico-chemical nature of the non-covalent interactions involved. Several independent approaches were used for this purpose: DFT-D3 calculations, Quantum Theory of Atoms in Molecules, Natural Bond Orbital Analysis, Energy Decomposition Analysis, Compliance Constant Theory, and Non-Covalent Interaction Analysis. The results point to an excellent degree of structural and energetic compatibility between the two types of model quadruplexes. This fact stems from both the structural features (close values of van der Waals volumes, pore radii, geometrical parameters of the H-bonds) and the energetic characteristics (comparablevalues of the energies of formation).

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Physical Chemistry Chemical Physics

ISSN

1463-9076

e-ISSN

—

Svazek periodika

16

Číslo periodika v rámci svazku

5

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

13

Strana od-do

2072-2084

Kód UT WoS článku

000329175700034

EID výsledku v databázi Scopus

—