High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F15%3A00081211" target="_blank" >RIV/00216224:14740/15:00081211 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://jcheminf.springeropen.com/articles/10.1186/s13321-015-0107-1" target="_blank" >http://jcheminf.springeropen.com/articles/10.1186/s13321-015-0107-1</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0107-1" target="_blank" >10.1186/s13321-015-0107-1</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications

Popis výsledku v původním jazyce

Background: Partial atomic charges describe the distribution of electron density in a molecule and therefore provide clues to the chemical behaviour of molecules. Recently, these charges have become popular in chemoinformatics, as they are informative descriptors that can be utilised in pharmacophore design, virtual screening, similarity searches etc. Especially conformationally-dependent charges perform very successfully. In particular, their fast and accurate calculation via the Electronegativity Equalization Method (EEM) seems very promising for chemoinformatics applications. Unfortunately, published EEM parameter sets include only parameters for basic atom types and they often miss parameters for halogens, phosphorus, sulphur, triple bonded carbonetc. Therefore their applicability for drug-like molecules is limited.

Název v anglickém jazyce

High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications

Popis výsledku anglicky

Background: Partial atomic charges describe the distribution of electron density in a molecule and therefore provide clues to the chemical behaviour of molecules. Recently, these charges have become popular in chemoinformatics, as they are informative descriptors that can be utilised in pharmacophore design, virtual screening, similarity searches etc. Especially conformationally-dependent charges perform very successfully. In particular, their fast and accurate calculation via the Electronegativity Equalization Method (EEM) seems very promising for chemoinformatics applications. Unfortunately, published EEM parameter sets include only parameters for basic atom types and they often miss parameters for halogens, phosphorus, sulphur, triple bonded carbonetc. Therefore their applicability for drug-like molecules is limited.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Cheminformatics

ISSN

1758-2946

e-ISSN

—

Svazek periodika

7

Číslo periodika v rámci svazku

DEC

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

1-10

Kód UT WoS článku

000366278000001

EID výsledku v databázi Scopus

—