Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Metatranscriptome analysis reveals host-microbiome interactions in traps of carnivorous Genlisea species

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F15%3A00084835" target="_blank" >RIV/00216224:14740/15:00084835 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2015.00526/abstract" target="_blank" >http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2015.00526/abstract</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00526" target="_blank" >10.3389/fmicb.2015.00526</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Metatranscriptome analysis reveals host-microbiome interactions in traps of carnivorous Genlisea species

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In the carnivorous plant genus Genlisea a unique lobster pot trapping mechanism supplements nutrition in nutrient-poor habitats. A wide spectrum of microbes frequently occurs in Genlisea's leaf-derived traps without clear relevance for Genlisea carnivory. We sequenced the metatranscriptomes of subterrestrial traps vs. the aerial chlorophyll-containing leaves of G. nigrocaulis and of G. hispidula. Ribosomal RNA assignment revealed soil-borne microbial diversity in Genlisea traps, with 92 genera of 19 phyla present in more than one sample. Microbes from 16 of these phyla including proteobacteria, green algae, amoebozoa, fungi, ciliates and metazoans, contributed additionally short-lived mRNA to the metatranscriptome. Furthermore, transcripts of 438 members of hydrolases (e.g., proteases, phosphatases, lipases), mainly resembling those of metazoans, ciliates and green algae, were found.

  • Název v anglickém jazyce

    Metatranscriptome analysis reveals host-microbiome interactions in traps of carnivorous Genlisea species

  • Popis výsledku anglicky

    In the carnivorous plant genus Genlisea a unique lobster pot trapping mechanism supplements nutrition in nutrient-poor habitats. A wide spectrum of microbes frequently occurs in Genlisea's leaf-derived traps without clear relevance for Genlisea carnivory. We sequenced the metatranscriptomes of subterrestrial traps vs. the aerial chlorophyll-containing leaves of G. nigrocaulis and of G. hispidula. Ribosomal RNA assignment revealed soil-borne microbial diversity in Genlisea traps, with 92 genera of 19 phyla present in more than one sample. Microbes from 16 of these phyla including proteobacteria, green algae, amoebozoa, fungi, ciliates and metazoans, contributed additionally short-lived mRNA to the metatranscriptome. Furthermore, transcripts of 438 members of hydrolases (e.g., proteases, phosphatases, lipases), mainly resembling those of metazoans, ciliates and green algae, were found.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EE2.3.20.0189" target="_blank" >EE2.3.20.0189: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in Microbiology

  • ISSN

    1664-302X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    6

  • Číslo periodika v rámci svazku

    july

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

    "nestránkováno"

  • Kód UT WoS článku

    000358573200001

  • EID výsledku v databázi Scopus