Metatranscriptome analysis reveals host-microbiome interactions in traps of carnivorous Genlisea species
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F15%3A00084835" target="_blank" >RIV/00216224:14740/15:00084835 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2015.00526/abstract" target="_blank" >http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2015.00526/abstract</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00526" target="_blank" >10.3389/fmicb.2015.00526</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Metatranscriptome analysis reveals host-microbiome interactions in traps of carnivorous Genlisea species
Popis výsledku v původním jazyce
In the carnivorous plant genus Genlisea a unique lobster pot trapping mechanism supplements nutrition in nutrient-poor habitats. A wide spectrum of microbes frequently occurs in Genlisea's leaf-derived traps without clear relevance for Genlisea carnivory. We sequenced the metatranscriptomes of subterrestrial traps vs. the aerial chlorophyll-containing leaves of G. nigrocaulis and of G. hispidula. Ribosomal RNA assignment revealed soil-borne microbial diversity in Genlisea traps, with 92 genera of 19 phyla present in more than one sample. Microbes from 16 of these phyla including proteobacteria, green algae, amoebozoa, fungi, ciliates and metazoans, contributed additionally short-lived mRNA to the metatranscriptome. Furthermore, transcripts of 438 members of hydrolases (e.g., proteases, phosphatases, lipases), mainly resembling those of metazoans, ciliates and green algae, were found.
Název v anglickém jazyce
Metatranscriptome analysis reveals host-microbiome interactions in traps of carnivorous Genlisea species
Popis výsledku anglicky
In the carnivorous plant genus Genlisea a unique lobster pot trapping mechanism supplements nutrition in nutrient-poor habitats. A wide spectrum of microbes frequently occurs in Genlisea's leaf-derived traps without clear relevance for Genlisea carnivory. We sequenced the metatranscriptomes of subterrestrial traps vs. the aerial chlorophyll-containing leaves of G. nigrocaulis and of G. hispidula. Ribosomal RNA assignment revealed soil-borne microbial diversity in Genlisea traps, with 92 genera of 19 phyla present in more than one sample. Microbes from 16 of these phyla including proteobacteria, green algae, amoebozoa, fungi, ciliates and metazoans, contributed additionally short-lived mRNA to the metatranscriptome. Furthermore, transcripts of 438 members of hydrolases (e.g., proteases, phosphatases, lipases), mainly resembling those of metazoans, ciliates and green algae, were found.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EE2.3.20.0189" target="_blank" >EE2.3.20.0189: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Frontiers in Microbiology
ISSN
1664-302X
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
july
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
"nestránkováno"
Kód UT WoS článku
000358573200001
EID výsledku v databázi Scopus
—