Enhancer-promoter interaction facilitated by transiently forming G-quadruplexes
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F15%3A00085546" target="_blank" >RIV/00216224:14740/15:00085546 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.nature.com/articles/srep09165" target="_blank" >http://www.nature.com/articles/srep09165</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep09165" target="_blank" >10.1038/srep09165</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Enhancer-promoter interaction facilitated by transiently forming G-quadruplexes
Popis výsledku v původním jazyce
G-quadruplexes are guanine-rich nucleic acid sequences capable of forming a four-stranded structure through Hoogsteen hydrogen bonding. G-quadruplexes are highly concentrated near promoters and transcription start sites suggesting a role in gene regulation. They are less often found on the template than non-template strand where they either inhibit or enhance transcription, respectively. However, their potential role in enhancers and other distal regulatory elements has not been assessed yet. Here we show that DNAse hypersensitive (DHS) cis-regulatory elements are also enriched in Gs and their G-content correlate with that of their respective promoters. Besides local G4s, the distal cis regions may form G-quadruplexes together with the promoters, eachcontributing half a G4.
Název v anglickém jazyce
Enhancer-promoter interaction facilitated by transiently forming G-quadruplexes
Popis výsledku anglicky
G-quadruplexes are guanine-rich nucleic acid sequences capable of forming a four-stranded structure through Hoogsteen hydrogen bonding. G-quadruplexes are highly concentrated near promoters and transcription start sites suggesting a role in gene regulation. They are less often found on the template than non-template strand where they either inhibit or enhance transcription, respectively. However, their potential role in enhancers and other distal regulatory elements has not been assessed yet. Here we show that DNAse hypersensitive (DHS) cis-regulatory elements are also enriched in Gs and their G-content correlate with that of their respective promoters. Besides local G4s, the distal cis regions may form G-quadruplexes together with the promoters, eachcontributing half a G4.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/ED1.1.00%2F02.0068" target="_blank" >ED1.1.00/02.0068: CEITEC - central european institute of technology</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Scientific Reports
ISSN
2045-2322
e-ISSN
—
Svazek periodika
5
Číslo periodika v rámci svazku
march
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
"nestránkováno"
Kód UT WoS článku
000351181900001
EID výsledku v databázi Scopus
—