Variation of 45S rDNA intergenic spacers in Arabidopsis thaliana

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00088684" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00088684 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68081707:_____/16:00506641

Výsledek na webu

<a href="http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11103-016-0524-1" target="_blank" >http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11103-016-0524-1</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s11103-016-0524-1" target="_blank" >10.1007/s11103-016-0524-1</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Variation of 45S rDNA intergenic spacers in Arabidopsis thaliana

Popis výsledku v původním jazyce

Approximately seven hundred 45S rRNA genes (rDNA) in the Arabidopsis thaliana genome are organised in two 4 Mbp-long arrays of tandem repeats arranged in head-to-tail fashion separated by an intergenic spacer (IGS). These arrays make up 5 % of the A. thaliana genome. IGS are rapidly evolving sequences and frequent rearrangements inside the rDNA loci have generated considerable interspecific and even intra-individual variability which allows to distinguish among otherwise highly conserved rRNA genes. The IGS has not been comprehensively described despite its potential importance in regulation of rDNA transcription and replication. Here we describe the detailed sequence variation in the complete IGS of A. thaliana WT plants and provide the reference/consensus IGS sequence, as well as genomic DNA analysis.

Název v anglickém jazyce

Variation of 45S rDNA intergenic spacers in Arabidopsis thaliana

Popis výsledku anglicky

Approximately seven hundred 45S rRNA genes (rDNA) in the Arabidopsis thaliana genome are organised in two 4 Mbp-long arrays of tandem repeats arranged in head-to-tail fashion separated by an intergenic spacer (IGS). These arrays make up 5 % of the A. thaliana genome. IGS are rapidly evolving sequences and frequent rearrangements inside the rDNA loci have generated considerable interspecific and even intra-individual variability which allows to distinguish among otherwise highly conserved rRNA genes. The IGS has not been comprehensively described despite its potential importance in regulation of rDNA transcription and replication. Here we describe the detailed sequence variation in the complete IGS of A. thaliana WT plants and provide the reference/consensus IGS sequence, as well as genomic DNA analysis.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Plant Molecular Biology

ISSN

0167-4412

e-ISSN

—

Svazek periodika

92

Číslo periodika v rámci svazku

4-5

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

15

Strana od-do

457-471

Kód UT WoS článku

000387114900005

EID výsledku v databázi Scopus

—