Repeated Whole-Genome Duplication, Karyotype Reshuffling, and Biased Retention of Stress-Responding Genes in Buckler Mustard

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00088730" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00088730 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.plantcell.org/content/28/1/17" target="_blank" >http://www.plantcell.org/content/28/1/17</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1105/tpc.15.00791" target="_blank" >10.1105/tpc.15.00791</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Repeated Whole-Genome Duplication, Karyotype Reshuffling, and Biased Retention of Stress-Responding Genes in Buckler Mustard

Popis výsledku v původním jazyce

Whole-genome duplication (WGD) is usually followed by gene loss and karyotype repatterning. Despite evidence of new adaptive traits associated with WGD, the underpinnings and evolutionary significance of such genome fractionation remain elusive. Here, we use Buckler mustard (Biscutella laevigata) to infer processes that have driven the retention of duplicated genes after recurrent WGDs. In addition to the beta- and alpha-WGD events shared by all Brassicaceae, cytogenetic and transcriptome analyses revealed two younger WGD events that occurred at times of environmental changes in the clade of Buckler mustard (Biscutelleae): a mesopolyploidy event from the late Miocene that was followed by considerable karyotype reshuffling and chromosome number reduction and a neopolyploidy event during the Pleistocene.

Název v anglickém jazyce

Repeated Whole-Genome Duplication, Karyotype Reshuffling, and Biased Retention of Stress-Responding Genes in Buckler Mustard

Popis výsledku anglicky

Whole-genome duplication (WGD) is usually followed by gene loss and karyotype repatterning. Despite evidence of new adaptive traits associated with WGD, the underpinnings and evolutionary significance of such genome fractionation remain elusive. Here, we use Buckler mustard (Biscutella laevigata) to infer processes that have driven the retention of duplicated genes after recurrent WGDs. In addition to the beta- and alpha-WGD events shared by all Brassicaceae, cytogenetic and transcriptome analyses revealed two younger WGD events that occurred at times of environmental changes in the clade of Buckler mustard (Biscutelleae): a mesopolyploidy event from the late Miocene that was followed by considerable karyotype reshuffling and chromosome number reduction and a neopolyploidy event during the Pleistocene.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Plant Cell

ISSN

1040-4651

e-ISSN

—

Svazek periodika

28

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

11

Strana od-do

17-27

Kód UT WoS článku

000369814300006

EID výsledku v databázi Scopus

—