Outcome of the First wwPDB/CCDC/D3R Ligand Validation Workshop

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00093806" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00093806 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0969212616000769" target="_blank" >http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0969212616000769</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.str.2016.02.017" target="_blank" >10.1016/j.str.2016.02.017</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Outcome of the First wwPDB/CCDC/D3R Ligand Validation Workshop

Popis výsledku v původním jazyce

Crystallographic studies of ligands bound to biological macromolecules (proteins and nucleic acids) represent an important source of information concerning drug-target interactions, providing atomic level insights into the physical chemistry of complex formation between macromolecules and ligands. Of the more than 115,000 entries extant in the Protein Data Bank (PDB) archive, similar to 75% include at least one non-polymeric ligand. Ligand geometrical and stereochemical quality, the suitability of ligand models for in silico drug discovery and design, and the goodness-of-fit of ligand models to electron-density maps vary widely across the archive. We describe the proceedings and conclusions from the first Worldwide PDB/Cambridge Crystallographic Data Center/Drug Design Data Resource (wwPDB/CCDC/D3R) Ligand Validation Workshop held at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics at Rutgers University on July 30-31, 2015.

Název v anglickém jazyce

Outcome of the First wwPDB/CCDC/D3R Ligand Validation Workshop

Popis výsledku anglicky

Crystallographic studies of ligands bound to biological macromolecules (proteins and nucleic acids) represent an important source of information concerning drug-target interactions, providing atomic level insights into the physical chemistry of complex formation between macromolecules and ligands. Of the more than 115,000 entries extant in the Protein Data Bank (PDB) archive, similar to 75% include at least one non-polymeric ligand. Ligand geometrical and stereochemical quality, the suitability of ligand models for in silico drug discovery and design, and the goodness-of-fit of ligand models to electron-density maps vary widely across the archive. We describe the proceedings and conclusions from the first Worldwide PDB/Cambridge Crystallographic Data Center/Drug Design Data Resource (wwPDB/CCDC/D3R) Ligand Validation Workshop held at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics at Rutgers University on July 30-31, 2015.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Structure

ISSN

0969-2126

e-ISSN

—

Svazek periodika

24

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

502-508

Kód UT WoS článku

000373568700005

EID výsledku v databázi Scopus

—