Basic domain of telomere guardian TRF2 reduces D-loop unwinding whereas Rap1 restores it
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F17%3A00095119" target="_blank" >RIV/00216224:14740/17:00095119 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/nar/article-lookup/doi/10.1093/nar/gkx812" target="_blank" >https://academic.oup.com/nar/article-lookup/doi/10.1093/nar/gkx812</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx812" target="_blank" >10.1093/nar/gkx812</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Basic domain of telomere guardian TRF2 reduces D-loop unwinding whereas Rap1 restores it
Popis výsledku v původním jazyce
Telomeric repeat binding factor 2 (TRF2) folds human telomeres into loops to prevent unwanted DNA repair and chromosome end-joining. The N-terminal basic domain of TRF2 (B-domain) protects the telomeric displacement loop (D-loop) from cleavage by endonucleases. Repressor activator protein 1 (Rap1) binds TRF2 and improves telomeric DNA recognition. We found that the B-domain of TRF2 stabilized the D-loop and thus reduced unwinding by BLM and RPA, whereas the formation of the Rap1–TRF2 complex restored DNA unwinding. To understand how the B-domain of TRF2 affects DNA binding and D-loop processing, we analyzed DNA binding of full-length TRF2 and a truncated TRF2 construct lacking the B-domain. We quantified how the B-domain improves TRF2’s interaction with DNA via enhanced long-range electrostatic interactions. We developed a structural envelope model of the B-domain bound on DNA. The model revealed that the B-domain is flexible in solution but becomes rigid upon binding to telomeric DNA. We proposed a mechanism for how the B-domain stabilizes the D-loop.
Název v anglickém jazyce
Basic domain of telomere guardian TRF2 reduces D-loop unwinding whereas Rap1 restores it
Popis výsledku anglicky
Telomeric repeat binding factor 2 (TRF2) folds human telomeres into loops to prevent unwanted DNA repair and chromosome end-joining. The N-terminal basic domain of TRF2 (B-domain) protects the telomeric displacement loop (D-loop) from cleavage by endonucleases. Repressor activator protein 1 (Rap1) binds TRF2 and improves telomeric DNA recognition. We found that the B-domain of TRF2 stabilized the D-loop and thus reduced unwinding by BLM and RPA, whereas the formation of the Rap1–TRF2 complex restored DNA unwinding. To understand how the B-domain of TRF2 affects DNA binding and D-loop processing, we analyzed DNA binding of full-length TRF2 and a truncated TRF2 construct lacking the B-domain. We quantified how the B-domain improves TRF2’s interaction with DNA via enhanced long-range electrostatic interactions. We developed a structural envelope model of the B-domain bound on DNA. The model revealed that the B-domain is flexible in solution but becomes rigid upon binding to telomeric DNA. We proposed a mechanism for how the B-domain stabilizes the D-loop.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10610 - Biophysics
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nucleic Acids Research
ISSN
0305-1048
e-ISSN
—
Svazek periodika
45
Číslo periodika v rámci svazku
21
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
12170-12180
Kód UT WoS článku
000417691300016
EID výsledku v databázi Scopus
—